Файл: Замятнин, А. А. Дилатометрия растворов белков.pdf

ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 30.10.2024

Просмотров: 41

Скачиваний: 0

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

А К А Д Е М И Я Н А У К С С С Р

институт биологической физики

А. А . З а м я т н и н

ДИ Л А Т О М Е Т Р И Я

растворов белков

И З Д А Т Е Л Ь С Т В О « Н А У К А » М О С К В А 197 3

УДК 620.181.428.405 : 532.77 : 547.96

Дилатометрия растворов белков. 3 а ы я т н п н А. А. М., «Наука», 1973 г., стр. 1—101.

В книге проанализированы и обобщены накопленные к настоящему времени

данные по исследованию

изменений объема растворов белков, а также амино­

кислот и

пептидов. Рассмотрены

методы экспериментального

наблюдения

h расчета

различных

объемных

эффектов.

Показано,

какие

меха­

низмы ответственны за проявление того или иного эффекта. Особое

внимание

обращено на эффекты, наблюдаемые в процессе конформационных

переходов

белков. Показано, как на основании данных дилатометрии возможно

полу­

чить сведения о структуре белка. Книга рассчитана на широкий круг чита­ телей: биофизиков, биохимиков, химиков, аспирантов и студентов, специа­ лизирующихся в области физической химии растворов макромолекул.

Табл. 8. Илл. 40. Библ. 245 назв.

Ответственный редактор

академик Г. М. ФРАНК

3

2-10-2-0525

БЗ-9-4-73

© Издательство «Наука», 1973 г.

 

U42 (02)

 


ОТ АВТОРА

Современный прогресс в области биофизики, биохимии, молекулярной биологии, физической химии макромолекул нераз­ рывно связан с ростом возможностей экспериментальных иссле­ дований. Почти все значительные открытия в физике или химии последних лет так или иначе были использованы при создании новых методов исследования в биологии и смежных н а у к а х . Све­ жие идеи этих открытий позволяли иначе взглянуть на давно изу­ чаемые объекты и явления и решать подчас совершенно новые за­ дачи.

Вместе с тем рост измерительной техники, создание веществ с новыми физико-химическими свойствами, новые конструкции приборов и многое другое способствовали улучшению, а иногда

воскрешению, методов

«со стажем», которые основаны на давно

известных

принципах .

Появилась возможность с помощью од­

ного и того

ж е метода

или прибора исследовать широкие классы

разнообразных веществ и процессов, получать результаты с боль­

шей

точностью, производить измерения в широком диапазоне

и т.

д.

Автор данной книги полагает, что дилатометрия, стаж которой давно перевалил за 100 лет, является методом, переживающим как бы свое второе рождение. Быстрый рост числа публикаций, посвященных дилатометрии растворов, свидетельствует о том, что этот метод завоевывает свое собственное место среди самых совре­ менных способов макроскопической характеристики свойств мо­ лекул и молекулярных процессов.

Поскольку метод существует, должно быть и соответствующее

руководство. Однако поиски

такого руководства не

увенчались

успехом. В связи с этим автор

в з я л на

себя смелость

дать х а р а к ­

теристику дилатометрии

к а к

метода, а

т а к ж е проанализировать

данные из сравнительно

небольшой области ее применения, вклю ­

чающей изучение белков, аминокислот и, частично, пептидов.

Большинство из поднятых здесь вопросов возникло

в

процес­

се работы в лабораториях

биофизики живых структур и

физичес­

кой биохимии Института

биологической физики А Н

СССР под

руководством акад. Г. М. Ф р а н к а и докт. биол. наук С. Э. Шноля . Многие взгляды, нашедшие отражение в этой книге, сформирова­ лись под влиянием покойного проф. Д . А. Франк - Каменецкого .

3


Автор искрение благодарит всех, кто в разное время советовал, помогал и порою дружески критиковал затронутые в книге проб­

лемы

и возможные пути их решения. Ими были

член-корр. А Н

В Н Р

проф. И . Тидьи, доктор физ.-мат. наук 10. Л .

Соколов, канд.

биол.

наук Н . А. Габелова, кандидаты физ.-мат.

наук В . И. Де -

щеревский, А. Н . Заикин, В . И . Пасечник. Р я д технических трудностей п р и создании экспериментальных установок был устра­

нен с

помощью Е . Е .

Измайлова

и

А. Н . Л у к а в е н к о .

Трудно -

оценимую

помощь при

подготовке

рукописи к печати

оказали

Е . П.

Бондаренко, канд. биол. наук

Л . Ю . Зыкова, И. Б . К у з ь ­

миных.

 

 

 

 

 

Все замечания в адрес этой книги будут приняты автором с бла­

годарностью.

 

 

 

 

Пупцшо

 

 

 

 

А.

Замятнин

январь

1973

г.

 

 

 

 

В В Е Д Е Н И Е

Б е л к и

представляют собой один из незаменимых

компонентов

живого.

Они составляют большую часть сухого

веса клетки.

Это объясняет тот большой и неиссякаемый интерес, который у ж е в течение длительного времени вызывает изучение свойств макро­

молекул

такого

типа.

 

 

 

 

 

 

 

К настоящему времени получено огромное количество сведе­

ний

о

составе,

структуре и функциях

многочисленных

белков.

Эта

информация

свидетельствует о

том, что

свойства

белковых

молекул

весьма

разнообразны. Б е л к и

могут

быть

сравнительно

небольшими молекулами (молекулярный вес меньше

1000)

и ог­

ромными (молекулярный вес более

1000 000).

И х

форма

бывает

в виде или длинного стержня или компактной структуры .

Они

могут объединяться с большими и малыми молекулами

других

типов и с себе подобными. С их участием осуществляются

много­

численные процессы, происходящие в живой клетке. Б е л к и встре­ чаются на всех уровнях иерархии живой материи.

Все эти сведения о белках можно было получить, только при­ менив огромное количество различных физико-химических мето­ дов исследования макромолекул . Использование всего арсенала методов и правильное их сочетание позволяет всесторонне изучить

и

описать

параметры

молекул

белка и роль

белковых

молекул

в

ходе биохимических

реакций, происходящих

как i n vitro, так

и

i n vivo .

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Одним из таких методов, позволивших расширить наши пред­

ставления

о структуре

и функциях

белков,

является

дилатомет­

р и я . Х а р а к т е р н а я особенность

этого

метода

заключается

в

том,

что он, чрезвычайно простой по своей идее и по реализации,

легко

может быть использован без большой затраты средств

практически

в^ любой

физико-химической,

физико-биологической

или

биохи­

мической

лаборатории.

 

 

 

 

 

 

 

Слово дилатометрия включает в себя два корня, один из кото­ рых я в л я е т с я основой латинского слова dilato — расширяю, а второй — греческого слова [летресо измеряю . Обычно дилато­ метрию принято считать разделом физики, посвященным изучению теплового расширения веществ и методам его измерения. Сущность метода состоит в том, что исследуемый образец подвергают иагреву и измеряют изменение его объема.

До недавнего времени дилатометрию большей частью исполь-

5


зовали для изучения только теплового расширения . С помощью дилатометров изучены температурные зависимости и анизотропия теплового расширения большого числа веществ. Именно эти ис­ следования и отражают название метода.

Однако к настоящему времени значение дилатометрии несрав­ ненно возросло, и существенно расширилась область ее примене­ ния . Большие успехи достигнуты в дилатометрическом исследова­

нии жидкостей,

растворов

и смесей. П р и этом получены

эффекты,

которые у ж е не

только

не отражают первоначальное

название

метода, а даже ему противоречат — существует большое

количест­

во эффектов (называемых нами в дальнейшем объемными), ха­ рактеризующихся не только расширением, но и сжатием системы. Более того, многие объемные эффекты получены в изотермических условиях, а, следовательно, не могут рассматриваться как тепло­ вые.

Существенные успехи в подобных исследованиях достигнуты после создания дилатометров, способных регистрировать объем­ ные эффекты в двухкомпонеитных системах. Это дало возможность исследоваталям «запускать» физико-химические реакции не толь­ ко с помощью внешних физических факторов (тепла, света и др . ),

но и при смешивании исследуемого вещества с каким-либо

хими­

ческим

агентом.

 

 

 

 

 

В ряде случаев дилатометрические исследования называют более

общим

словом — волюмометрия, полнее отражающим

х а р а к ­

тер проводимых измерений. Однако

в

зарубежной литературе

этот же термин является устоявшимся названием раздела

анали ­

тической

химии — объемного анализа

(volumetric

analysis).

Ви ­

димо, поэтому термин дилатометрия не прекратил своего

сущест­

вования

и используется по настоящее

время. Во

всяком

случае

в литературе довольно часто встречается

описание

волюмометров

и дилатометров различных типов, которые предназначены

дл я вы­

полнения одних и тех же измерений — изменений объема системы. Существенная разница, п о ж а л у й , состоит в том, что приборы, именуемые дилатометрами, используют при исследовании кине­ тики сравнительно медленных изменений объема (длящихся более 10 сек.). С помощью ж е волюмометров обычно наблюдают про ­ цессы изменения объема, завершающиеся в пределах 1 сек. (на­

пример,

при

сокращении

мышцы, цикл сокращения

которой со­

ставляет

6 0

мсек).

 

 

 

 

 

Простота осуществления дилатометрических и волюмометри-

ческих измерений может объяснить тот факт, что попытки

поста-

витьЦтакие исследования

были предприняты

еще в

X V I I

веке .

Эти исследования были посвящены стоявшей у ж е тогда

проблеме

мышечного сокращения . В

то время предполагали, что из нерва

в мышцу для ее активации

движется «живой дух»:. Д л я

проверки

этого предположения Сваммердам (возможно,

один

из

первых)

в 1660 году провел волюмометрические измерения системы, кото­ рая содержала в себе сокращающуюся мышцу. Однако замечен-

6


ный им эффект имел знак, противоположный ожидаемому, и, следо­ вательно, гипотеза «живого, духа» не выдержала проверки.

Конечно, эти и ряд других измерений (Борелли, Глиссон п др.) того времени для нас представляют в основном исторический ин­ терес. Современные исследования позволили изучить объемные эффекты при сокращении мышцы гораздо глубже, и им может быть посвящена специальная монография.

Следует отметить, что в процессе рождения новых наук — биофизики и молекулярной биологии, стало возможным изучение многих биологических процессов на молекулярном уровне. Д л я этой цели привлекаются все подходящие физико-химические ме­ тоды исследования макромолекул в растворе, в том числе и ди­ латометрия. И в области исследований, посвященной дилатометрии макромолекул, безусловно первое место следует отвести белкам,

С помощью дилатометрии оказалось возможным получить све­ дения об объемных эффектах, сопровождающих разрыв сильных связей, и при различных конформационных переходах белков. Примером первых с л у ж а т тщательные исследования Линдерштрема - Ланга, посвященные изучению эффектов, сопровождающих разрыв пептидных связей. В частности, дилатометрические иссле­ дования позволили ему установить, что белковая молекула в силу своей специфической структуры занимает больше места, чем про­ стая сумма ее элементов.

Что ж е касается объемных эффектов при конформационных переходах, то литература по этому вопросу непрерывно попол­ няется новыми данными. Это объясняется в первую очередь по­

стоянным ростом техники

дилатометрических

измерепий.

В настоящее время стало возможным регистрировать объем­

ные

эффекты,

составляющие всего

Ю - 7

часть

объема

системы.

Т а к а я чувствительность дилатометров позволяет изучать

процес­

сы,

которые

обусловлены

разрывом

или

образованием

слабых,

а т а к ж е единичных сильных связей, что осуществимо с помощью крайпе ограниченного числа методов.

Изменение объема раствора белка отражает изменение состоя­ ния макромолекул и низкомолекулярных соединений в растворе, в том числе молекул воды. Практически любое изменение-хими­ ческого состава и структуры растворенных веществ должно при ­ водить к изменению взаимодействия с окружающими молекула­ ми. Наблюдение изменения объема раствора дает возможность говорить об изменении взаимодействия молекул в растворе, при­ водящем к изменению межмолекулярных расстояний, упаковки

идругих микрохарактеристик .

Вобщем случае изменения объема водного раствора белка могут осуществляться практически при любых конформационных превращениях этого белка, ибо при этом происходят изменения

величины и

состава поверхности взаимодействия

макромолекулы

с окружением (ионами, молекулами воды, малыми

органическими

молекулами,

макромолекулами того ж е или другого типа, макро-