Файл: Модуль і. Основи інформаційних технологій в системі охорони здоров'Я. Обробка та аналіз медикобюлогічних даних.doc

ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 19.03.2024

Просмотров: 215

Скачиваний: 0

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

СОДЕРЖАНИЕ

a b| Ф Щ :| J jhz yjШ& Р ис. 6. Панель інструментів Формы Поля формиПанель інструментів Фор.мы містить кнопки, призначені для вставлення полів, створення таблиць і рамок, засоби захисту форми, які дають змогу користувачам вводити дані тільки у відведені для цього поля. Призначення інструментів панелі інструментів Фор.мы відображено в табл. 1 14Таблиця І. Призначення інструментів панелі інструментів Формы

Рис. 17. Режим коиструктори для таблиці «Пацієнти»Зв'яжи між таблицями, які забезпечують посилальну цілісність даних, наглядно представлено на схемі даних (команда меню Сервис/Схема данных (рис. 18). 32i>] Microsoft Access - [Снема данных]

Access.

лі = 9. Обчислення критерію вірогідності коефіцієнта кореляції:t =10. Визначення стандартних значень критеріїв Ст'юдента відповідно трьомпрограмам вірогідності (95%, 99%, 99,9%) за допомогою таблиці для кількостіступенів свободи (див. вище) v=2n-2.11. Порівняння коефіцієнтів вірогідності коефіцієнта кореляціїстандартними значеннями критеріїв Ст'юдента. Висновок про вірогідністькоефіцієнта кореляції. 72В MS Excel для обчислення цього параметру існує вбудована функція КОРРЕЛ.Практичні завданнясЗь Завдання 1. Обчислення основних статистичних характеристик вибірок.Визначити середнє арифметичне, середнє квадратичне відхилення, помилку репрезентативності, моду та медіану результатів вимірювання швидкості кровотоку 10 пацієнтів до наркозу.

І1,844ег при х = 0 (уі>= 11.84 мг/л).

Рис. 62. Форма для списку лікарських засобівСтворена форма призначена насамперед для зручного введення інших записів (рядків) у цю таблицю даних (хоча можна і безпосередньо заповнювати таблицю). Щоб додати ще один запис до таблиці, використовують кнопку Добавить, після чого заповнюють усі поля для наступного запису. Якщо в списку є поля, які обчислюються програмою, вони також подаються у формі, але без відповідних полів введення даних. Для перегляду вже заповнених записів використовують кнопки Напад і Далее.Крім того форма дає змогу шукати записи за певними критеріями. Для цього потрібно клацнути на кнопці Критерии, після чого у правому верхньому куті форми з'являється напис Критерии. Якщо заповнити відповідні поля форми? кнопки Назад і Далее показуватимуть лише ті записи таблиці, що задовольняють введеним умовам. Для числових полів можна вводити математичні умови порівняння (=, <, >, о, <=, >=). У текстових полях можна використовувати символи шаблону (* - будь-яка кількість будь-яких дозволенних символів, ? -будь-який один довільний символ).З даними у списку в Excel можна здійснювати перетворення різного типу, зокрема, сортування та вибірку. На схемі 7 подано алгоритм виконання вказаних операцій. З детальним описом вказаних дій модна ознайомитися у Додатку. 127Сортування і вибіркаІ

Одне з найпростіших - сортування виконується за допомогою команди Сортировка пункту меню Данные. Програма автоматично розпізнає таблицю даних (коли активною є комірка всередині списку) і відкриває діалогове вікно Сортировка диапазона (рис. 76).Сортировка диапазонаСортироеать поЗ атем по ft' по убьів-afnw |Лк»оька фарна _^J t# по еоэрастетиюБ последнюю очереди по — |Показання до mcti_tJ & по еограстанио^ г» y6biMf*irt) Идентифицировать поля m'* подписям (первая строка диапазона)" обдзнщечняі* стогоцо* чиста гтарепетры...окJОтпнма Рис: 73. Діалогове вікно «Сортировки диапазона» 149Якщо перший рядок відформатований інакше або містить об'єкти, що відрізняються від об'єктів інших рядків, у діалоговому вікні пропонується здійснити сортування за назвами цих стовпців. В іншому разі Excel використовує безпосередні назви стовпців, наприклад ІСтол6еаА JJj |столбеие jj Змінити автоматичний вибір програми можна за допомогою поля Идентифицировать поля по. Діалогове вікно Сортировка диапазона дає змогу вибрати черговість сортування за стовпцями і напрям сортування кожного із стовпців. Якщо список треба відсортувати тільки за одним полем списку, слід зробити активною одну з комірок цього стовпця та скористатися відповідними кнопками панеліАІ ЯІінструментів Стандартная, за зростанням я+ або ж за спаданням At.Для сортування лише частини списку необхідно виділити потрібний діапазон комірок і виконати команду Сортировка. Якщо виділено не всі комірки рядків, то переміщування стосуватиметься лише виділених комірок, а в інших переміщувань не відбудеться, тобто записи (внутрішні зв'язки інформації) будуть зруйновані і список зіпсується. В Excel можливе сортування за встановленими в програмі списками (днітижня, місяці року тощо), а також за списками користувача, що створюються задопомогою вкладки Списки діалогового вікна Параметры, яке викликаєтьсяоднойменною командою пункту меню Сервис (рис. 77): Международные Сохранение Вид Вычислений ПравкаСписки:Параметры Орфография БезопасностьСписки Диаграмма Цр*т Проверка ошибде Общие ПереходЭлементы списка: M onday, Tuesday, Wednesday, Thursday, *. | Jan, Feb, Mar, Apr, May, Jun, Jul, Aug, 5e January, February, March, April, May, Jum Пн, Єт, Cp, Чт, Пт, Сб, Єс Понедельник, Вторник, Среда, Четверг, янв, фее, мар, апр, май, ннэн, июл, авг. Январь, Февраль, Март, Апрель, Май, И Пн, Вв, Ср, Чт, Пт, Сб, Цд Понеділок, Вівторок, Середа, Четвер, П Січ, ГЬог, Бер, Кві, Тра, Чер, Лип, Сер, В , Лютий, Березе^, Квітень, ТравіN9. Нііва. Пікаоська *<49НазваЛікарська формаПоказання до застосуваннявиробникКількість упаковокЦіна, грнТермін придатностіДобавить Импорт списка из ячеек:Импорт O KОтмена Р ис. 74. Діалогове вікно «Параметры», вкладка «Списки»Список користувача можна ввести в поле Элементы списка в окремих рядках, а потім клацнути на кнопці Добавить. Якщо список уже міститься в певному діапазоні комірок робочого аркуша, достатньо ввести цей діапазон у поле Импорт списка из ячеек і клацнути на кнопці Импорт. Список користувача, що задає порядок сортування, потрібно вибрати у діалоговому вікні Параметры 150сортировки (кнопка Параметры діалогового вікна Сортировка диапазона) у полі Сортировка по перео.му ключу. Порядок сортування за списком користувача можна застосовувати тільки для сортування за першим параметром.Порядок корчування, що викорисювусться за замовчуванням,При сортуванні за зростанням Excel використовує наступний порядок: - Числа сортуються від найменшого від'ємного до найбільшого додатного числа.Ллфаеітно-цифрове сортування. При сортуванні алфавітно-цифрового тексту програма порівнює значення за знаками зліва направо. Наприклад, якщо комірка містить текст «А 100», Excel помістить її після комірки, що містить запис «А1», і перед коміркою, що містить запис «А1 \».Текст, що містить числа, сортується в наступному порядку: 0123456789 (пробіл) !"#$%&()*,./:;?@[\]Л_4{|}

Найти и заменить | Заменить Найти:- М еньше *Отмена П араметры поискаН аправление: Везде _" 5і»«тьвать регистрТолько слово целиком Подртановочные знаки Цмиїносится как Все словоформы НайтиФормат * Специальные тР ис. 77. Діалогове вікно Найти и іаменитьЗаміна тексту.Іноді може знадобитися замінити існуючий текст на новий. Для цього можна вибрати вкладку Заменить діалогового вікна Найти и заменить або вибрати відповідну команду у меню Правка. У вкладці Заменить слід ввести умови пошуку й заміни:у полі Найти - ввести фрагмент тексту, який необхідно замінити;- у полі Заменить на - ввести фрагмент тексту для заміни;— натиснути кнопку Найти далее; 159для заміни знайденого слова - натиснути кнопку Заменить, для заміни усіх фрагментів, що задовольняють умови, натиснути кнопку Заменить есе.Закриття документуДля закриття документувиконайте одну з наступних дій наступне: клацніть на кнопці Ш вікна документа; у меню Файл виберіть пункт Закрити. Створення нового документуДля створення нового документу виконайте одну з наступних дій: клацніть на кнопці J на стандартній панелі інструментів;- у меню Файл виберіть пункт Створити.Відкриття файлуЩоб відкрити файл, що зберігається на диску для виправлення, доповнення і збереження внесених змін, потрібно: клацнути на кнопці lJ панелі інструментів; в меню Файл вибрати пункт Відкрити для виклику діалогового вікнаВідкриття документа. У діалоговому вікні, що відкриється вибрати в графі Папка потрібний диск або папку, у якій знаходиться шуканий документ; знайти в списку файлів потрібний, виділити його; натиснути кнопку Відкрити (або клацнути на шуканому документі двічі).Є зручний спосіб швидко відкрити файл. Word зберігає імена останніх чотирьох файлів, з якими ви працювали, і виводить їх у нижній частині меню Файл. Щоб відкрити один з цих документів, просто зайдіть у меню Файл і клацніть на імені потрібного документа.160Додаток А, Основи роботи в табличному процесорі Excel Запуск ExcelДля запуску Excel необхідно скористатися меню, яку з'являється при натисненні на кнопку Пуск.Після запуску на екрані з'явиться головне вікно програми Excel (рис. 78).Q Micrnscrfi Fmtp| - Кнн/лі фдйл Правка ^ id J> ^JА І &*І ftн Г' _ В я м * * ^^^лиtтl/г^gт2^гvlcтg/>J EJ Hcrosrft Ечсті-ии Е В ^j« Рис. 78.Вікно табличного процесораТаблиця в Excel називається Робочим аркушем. Один файл Excel може містити декілька робочих аркушів і називається робочо/о книгою. Для вибору потрібного робочого аркуша в нижній частині вікна знаходяться ярлички робочих аркушів. Вибір аркуша здійснюється клацанням миші на потрібному ярличку.Відкриття робочої книгиДля відкриття робочої книги виконайте один і перерахованих способів: за допомогою кнопки t-Jf на панелі інструментів Стандартная, за допомогою команди Відкрити в меню Файл. Створення нової робочої книги.Існує два способи створення нової робочої книги:- в меню Файл вибрати команду Створити,клацнути на кнопці 1. панелі інструментів Стандартная. Введення данихВведення може здійснюватися тільки в активну (виділену) комірку. Зміна 161активної комірки здійснюється за допомогою кнопок управління курсором (стрілок) або маніпулятором типу миша.Введення інформації в активну комірку виконується в Рядк)> формул і закінчується натисненням кнопки Enter.Для видалення вмісту комірки необхідно встановити табличний курсор на потрібну комірку і натиснути кнопку Delete.ВидІлення блоку комірокДля виділення блоку комірок необхідно вказівник мишї встановити в лівому верхньому куту блоку, натиснути ліву кнопку миші і, не відпускаючи, перемістити вказівник в правий нижній куток блоку комірок. Відпустити ліву кнопку.АвтозаповненияАвтозаповненням можна створювати послідовності даних у вигляді арифметичної прогресії. Для цього в дві сусідні комірки вводять перший і другий члени арифметичної професії. Далі, виділивши блок вказаних комірок, протягуванням отримують всі потрібні значення арифметичної прогресії (за правий нижній куток виділеного блоку протягують до комірки, що містить останній член прогресії).АвтосумуванияВстановити табличний курсор в комірку, в якій повинна знаходитися сума. Вказівником миші натиснути кнопку Автосумма на панелі інструментів.Якщо блок, що вказаний пунктиром, відповідає потрібному діапазону сумування, натиснути кнопку Enter. В протилежному випадку за допомогою вказівника миші виділити потрібний блок і натиснути кнопку Enter.Введения математичних формулВведення формули повинне починатися зі знаку = (дорівнює). Всі записи в формулах повинні здійснюватися латинськими буквами (для зміни мови натиснути комбінацію кнопок Alt+Shift або Ctrl-i-ShLft). В формулах використовуються знаки: + (додавання), - (віднімання), * (множення), / (ділення), Л (піднесення до степеня), а також спеціальні функції (кнопка Вставка функции (f4) на панелі інструментів Стандартная). Для задания послідовності операцій використовуються круглі дужки ().Копіювання формулКопіювання формул здійснюється аналогічно звичайній процедурі копіювання. При цьому відбувається автоматична зміна адрес комірок, тобто результат в наступній комірці обраховується для даних, отриманих із нових комірок (зазвичай сусідніх з початковими). Якщо необхідно, щоб адреса якоїсь комірки в формулі залишалась незмінною, то перед буквою і цифрою адреси комірки ставиться знак S. Наприклад, $G$23.Друк результатів162Друк всього робочого листа:перед друком необхідно переконатися, що вміст і форма документа, що виводиться мають потрібний вигляд. Для цього на панелі інструментів за допомогою миші натиснути кнопку Предварительный просмотр;у випадку якщо документ задовольняє всі вимоги, на панелі інструментів натиснути кнопку Печать.,в діалоговому вікні друку, що з'явилося натиснути кнопку ОК.Друк фрагменту робочого листа:- виділити блок потрібного фрагменту за допомогою миші;відкрити розділ меню Файл, вибрати пункт Область печати і підпункт Задать;- далі перейти до пункту 1.1 друку всього робочого листаДрук однієї діаграми: активувати потрібну діаграму; далі перейти до пункту 1.1 друку всього робочого листа Форматування рамки таблицівиділити блок комірок, вздовж границь яких повинна бути проведена лінія;за допомогою миші на панелі інструментів Фор.матыроеание натиснути стрілку справа від кнопки Граница.в меню, що відкрилося вибрати місцезнаходження і тип рамки. Клацнути лівою кнопкою миші.якщо рамка сформована не повністю, повторити процедуру, починаючи з п.1.Для видалення рамки слід виділити відповідний блок комірок, повторити п.2 і в меню, що відкриється вибрати варіант без решки (лівий верхній квадрат).Відміна дійДля відміни дій використовуються кнопки ' і на панелі інструментів Стандартная.Повідомлення про помилки#ДЕЛ/О! - спроба ділення на нуль. #ИМЯ? - ім'я функції задано невірно. #Н/Д- немає даних в комірці.#ЧИСЛО! - проблема з числовим значенням (наприклад, комірка містить від'ємне число замість додатного).1631   ...   57   58   59   60   61   62   63   64   65

між різними фахівцями і клініками (наприклад, для консультацій у складних клінічних випадках), підтримку електронних архівів пацієнтів, передачу зображень засобами комп'ютерної мережі. Для усунення несумісності між різними медичними системами Американським радіологічним коледжем (American College of Radiology, ARC) і Національною асоціацією виробників електроніки (National Electrical Manufacturers Association, NEMA) було розроблено єдиний уніфікований стандарт для передачі і зберігання медичних зображень - Digital Imaging and Communications in Medicine або скорочено DICOM. Перша версія уніфікованого стандарту ARC/NEMA 1.0 (DICOM 1.0) з'явилася в 1985 році. На сьогодні загальноприйнятим стандартом є його версія DICOM 3.0, що підтримується практично всіма виробниками медичного обладнання. У форматі DICOM 3.0 можуть зберігатися результати обстеження,

55

отримані різними системами медичної візуалізації рентгеноконтрастної комп'ютерної томографії (СТ), магнітно-резонансної томографії (MRI), цифрової рентгенографії та флюрографії (RF), ангіографії (ХА), дані ультразвукових методів дослідження (US), радіонуклідної діагностики (NM) тощо. При цьому структура й обсяг інформації будуть істотно залежати від виду проведеного обстеження. Наприклад, у результаті СТ-обстеження пацієнта одержуємо деяку кількість так званих серій (series) зображень (кількість серій зумовлена проекцією та використаними СТ-режимами), а кожна серія міститиме певну кількість окремих статичних зображень (images). При збереженні результатів обстеження пацієнта на US-сканері, коли одержувана інформація швидко змінюється в реальному часі, матимемо велику кількість окремих зображень, однак записаних з
дуже малими проміжками часу (частота дискретного запису вимірюється в міл і секунд ах). При наступному перегляді отриманих результатів зі швидкою зміною зображень виникає ефект наближений до «живого відео», і відповідно картина, максимально подібна до тієї, яку спостерігає лікар під час безпосереднього проведення дослідження. Формат DICOM передбачає можливість збереження реальної відео й аудіо інформації.

У сучасній медичній клініці отримані результати обстежень пацієнтів деякий час зберігаються в оперативній пам'яті медичної апаратури, з допомогою якої було проведено дослідження. Однак оперативна пам'ять обмежена за обсягом і не призначена для тривалого зберігання даних, необхідних у науковій роботі. Як правило, можлива архівація результатів досліджень безпосередньо із приладу, яким виконується дослідження, на змінні носії інформації. Інший варіант використання систем передачі й архівації зображень (Picture Arhiving and Communication System, PACS), які передбачають створення спеціальних вилучених архівів на серверах, де досить об'ємний архів може існувати тривалий час і бути доступним для пошуку й перегляду інформації, що цікавить користувача, через комп'ютерні мережі. Після архівування результатів дані можуть бути вилучені з оперативної пам'яті приладу, яким проводилося дослідження.

У медичній практиці часто виникає потреба у додатковій обробці отриманих результатів дослідження (як правило, для поліпшення візуалізації виявленої патології або для спеціальних наукових досліджень). У такому випадку використовують графічні станції - комп'ютери, оснащені потужним спеціальним програмним забезпеченням для роботи із зображеннями (застосування різних графічних фільтрів, тривимірних реконструкції тощо) з наступним переглядом отриманих результатів (наприклад, на клінічних конференціях або безпосередньо в операційній - в умовах хірургічного стаціонару). Дані для аналізу можуть бути

передані на графічну станцію як з електронного архіву, так і безпосередньо з апарата, на якому виконано дослідження. Дотепер графічні станції для обробки медичної інформації випускалися нечисленними фірмами-виробниками й базувалися тільки на дорогих платформах SUN MICROSYSTEMS, SILICON GRAFIX та ін. Безумовно надійність цих систем відносно як апаратної частини, так і програмного забезпечення не викликає сумнівів, оскільки вони споконвічно були орієнтовані на промислове вузькоспеціалізоване застосування. Однак їхня

56

вартість дуже вис ока, а тому не всі медичні клініки можуть мати подібне технічне оснащення. Тим часом парк «менше надійних», але набагато дешевших, значно поширених IBM-сумісних комп'ютерів на сьогодні істотно поновився. Сучасні персональні IBM-сумісні комп'ютери практично наздогнали по потужності, продуктивності і надійності дорогі елітні платформи. З'явилися центральні процесори з тактовою частотою більше 2ГТц, істотно знизилися ціни на оперативну пам'ять, і ПК з оперативною пам'яттю 2 ГВ вже нікого не дивують. Таким чином, у програмістів з'являється можливість створити прикладне програмне забезпечення для перегляду й обробки медичної графічної інформації на IBM-сумісних комп'ютерах. На сьогодні вже існує ціла низка різноманітного програмного забезпечення для роботи з медичними графічними зображеннями на IBM PC. Переважна більшість таких програмних продуктів призначена для перегляду, передачі по локальній мережі, Internet й архівування результатів медичних досліджень. Пакети призначені для графічної постобробки результатів медичної візуалізації для IBM-сумісних комп'ютерів на сьогодні поодинокі.

Усі програми для роботи з медичними зображеннями можна розділити умовно на кілька категорій:

1) програми для перегляду медичних зображень (так звані «в'юєри»

(viewers);

  1. програми для створення архіву DICOM-зображень;

  2. пограми для передачі зображень через локальну мережу й Інтернет;

4} системні утиліти (утиліти перекодування зображень у різні медичні і стандартні графічні формати, редактори медичних файлів у двійковому коді, утиліти підтримки спеціалізованих медичних накопичувачів інформації тощо);

5) службові програми й бібліотеки підтримки DICOM-формату в різних стандартних офісних, графічних й Інтернет-додатках (DICOMHTML-технології). Деякі програми інтегрують у собі перераховані функції, будучи універсальним інструментом фахівця функціональної діагностики.

Для перегляду й аналізу DІ СОМ -файлів можна скористатися, зокрема,
безкоштовною програмою DICOM Image Viewer Plus

іhttp://www.unipacs.сonVru/uniViewP 1 us.html). Вона характеризується практично повною функціональністю робочої станції, за винятком роботи в DICOM-мережі. За допомогою цієї програми ви зможете переглядати зображення з діагностичною, сертифікованою якістю, організувати електронний архів DІ СОМ-файлів на диску, легко відкривати їх та експортувати в BMP, JPEG і PGM формати, сканувати знімки в DICOM, аналізувати їх. Набір функцій для перегляду медичних
зображень включає: вибір кількості зображень, що переглядаються одночасно, масштабування зображення (Zoom, Magnify), настроювання яскравості й контрастності зображення, зміну орієнтації зображення (Flip, Rotate). Крім того, існує можливість вибору зони інтересу з вимірювання її розмірів, виміру відстані та площі між анатомічними об'єктами.

Практичні завдання Заедания І. Ознайомлення з інтерфейсом та панеллю інструментів

57 програми DICOM Image Viewer Plus.

Завантажте програму для перегляду медичних зображень DICOM Image Viewer Plus (Робочий стіл/Програми для занять/ UniViewer). Ознайомтеся з інтерфейсом та панеллю інструментів програми (рис. 31, 32).



_ a1 X


Anonymiied Anonymized