ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 18.10.2024
Просмотров: 69
Скачиваний: 0
CRYSTAL STRUCTURE
ANALYSIS: A PRIMER
и«учью-то^"'.Ичная
библиотека';1'®0^'"' _3K3EMnjlf7p
- d ^ ^ - o r n ) ЗАЛА
Jenny Pickworth Glusker
The Institute for Cancer Research — Fox Chase,
Philadelphia
Kennelli N. Trueblood
University of California
NEW YORK
OXFORD UNIVERSITY PRESS
LONDON 1972 TORONTO
ДЖ. ГЛАСКЕР, К. ТРУБЛАД
АНАЛИЗ
КРИСТАЛЛИЧЕСКОЙ
СТРУКТУРЫ
Перевод д, английского доктора физ.-мат. наук В. Г. Дантевского
Издательство «Мир» Москва 1974
УДК 543.422.8 |
|
Л ? |
Гос. публичная |
|
научно-техническая |
|
библиотека СССР |
|
ЗКЗЕМПЛГ.Р |
|
ЧИТАЛЬНОГО ОА ЛА |
Книга представляет собой краткое введение в рент геноструктурный анализ монокристаллов. По уровню и
характеру |
изложения книга близка к |
монографии |
П. Уитли |
«Определение молекулярной |
структуры» |
(«Мир», 1970). Несмотря на то, что книга написана весьма лаконично, она содержит практически все сведе ния, необходимые для понимания роли и возможностей рентгеноструктурного анализа. Примеров расшифровки структур немного, но они очень показательны.
Книга окажет большую помощь студентам и моло дым научным работникам — химикам и физикам.
Редакция литературы по химии
20503-079
Г 041 (01)-74 79-74 © Перевод на русский язык, «Мир», 1974,
ПРЕДИСЛОВИЕ
Данная книга, являющаяся кратким введением в
рентгеноструктурный анализ монокристаллов, адресо вана студентам — физикам и химикам, а также ис следователям, которые, не собираясь стать специали- стами-кристаллографами, просто хотят получить пред ставление о принципах, лежащих в основе определе ния кристаллической и молекулярной структуры.
В советской литературе имеется немало пособий по рентгеноструктурному анализу, предназначенных как для научных работников, так и для студентов и аспирантов, специализирующихся в этой области. Од нако простого, интересного и современного вводного курса, по-видимому, еще нет, если не считать гл. 6—8 в книге П. Уитли «Определение молекулярной струк туры» («Мир», 1970). Книга Дж. Гласкер и К. Трублада, несомненно, значительно глубже преподносит основы структурного анализа и в то же время еще достаточно проста, чтобы быть понятной химикам, не имеющим отчетливого представления о рядах Фурье.
Авторы задались целью показать, почему и каким образом молекулярную структуру можно определить из рентгенограммы монокристалла. Для этого они от вечают на следующие вопросы: почему необходимо использовать кристаллы, а не жидкости или газы? Почему нужны рентгеновские лучи, а не какое-либо другое излучение? Какие при этом требуются экспе риментальные измерения? Каковы этапы определения типичной структуры? Почему анализ часто оказы вается столь длительным и сложным и как можно убедиться в правильности найденной структуры? Хотя эта книга написана очень лаконично, она содер жит практически все сведения, необходимые для по нимания значения и возможностей рентгеноструктурирг<? анализа, Примеров расшифровки структур
6 Предисловие
приведено немного, но они . весьма показательны. Рисунки и подписи к ним являются неотъемлемой частью текста и способствуют лучшему усвоению материала. Большое удобство для читателей пред ставляет и другой вспомогательный материал — список обозначений, подробный терминологический словарь, а также список оригинальных работ, из которых заимствованы приводимые в книге иллю страции. Что же касается аннотированной библио графии, то в переводе она несколько изменена. В частности, включены ссылки на книги, которые мо гут быть полезны советскому читателю и в то же время легко доступны ему.
В заключительной части предисловия обычно при нято говорить о недостатках. Мне кажется, что при влечение некоторых теоретических представлений, та ких, как теория плотной упаковки молекул. в кри сталле -и конформационная теория, было бы весьма желательным для любого вводного курса по рентге ноструктурному анализу. Эти представления в по следние годы широко вошли в практику определения кристаллической и молекулярной структуры. Так, не которые исследователи, используя информацию о типе и параметрах элементарной ячейки, ищут опти мальную укладку молекул, минимизируя потенциаль ную энергию кристалла по положению и ориентации этих молекул. Знание потенциальных функций, опи сывающих конформационные состояния молекул, не редко оказывают большую помощь при расшифровке структуры таких сложных молекул, как белки и ну клеиновые кислоты. Польза от теоретических методов заключается, во-первых, в возможности выбора наи более реалистичных пробных структур и, во-вторых, в уменьшении числа варьируемых параметров при уточнении структуры.
В. Дашевский
Тем, кто обучил нас кристаллографии, и особенно Дороти Хочкин, А. Паттерсону, Дж. Стердиванту, Р, Кори и Шомейкеру, а также памяти АСз (the Advisory Council on College Chemistry)
ПРЕДИСЛОВИЕ АВТОРОВ К РУССКОМУ ИЗДАНИЮ
Писать предисловие к переводу нашей книги — большое удовольствие для нас. Оба мы посетили
СССР в 1966 г. и приняли участие в работе VII Меж дународного конгресса кристаллографов в Москве, а один из нас (К. Трублад) удостоился чести еще трижды посетить эту страну, включая очень денное и приятное пребывание в лаборатории профессора А. И. Китайгородского в течение двух месяцев в 1965 г. Среди друзей и коллег в те счастливые для нас дни был и наш переводчик д-р В. Г. Дашевский.
Мы предприняли попытку написать введение в
рентгеноструктурный анализ, которое должно оказать пользу не только тем, кто собирается читать более серьезные книги по этой теме, но также и тем, кто просто хочет уяснить основные принципы анализа и понимать (и оценивать) статьи по структурной кри сталлографии, которые сейчас публикуются в боль шом количестве. В этих статьях приводятся экспери ментальные результаты, представляющие интерес для целого ряда дисциплин — химии, биохимии, физики, геологии и других. Мы включили многочисленные ил люстрации с подписями, составляющими существен ную часть текста, выводы в конце каждой главы, достаточно подробный словарь распространенных тер минов, общую аннотированную библиографию и спи сок использованных обозначений.
Наша цель заключалась в том, чтобы объяснить, почему и каким образом в результате анализа дифракционных картин, полученных при рассеянии рентгеновских лучей (или нейтронов) на атомах мо нокристалла, можно определить полную трехмерную
8 Предисловие авторов к русскому изданию
архитектуру молекулы. Часть I, состоящая из первых четырех глав, касается природы кристаллического состояния, некоторых важных фактов, имеющих отно шение к дифракции вообще и особенно к дифракции от кристаллов. Кроме того, в этой части кратко из ложены техника и приемы рентгеноструктурного эксперимента. В части II рассмотрены проблемы пре образования экспериментальных данных (по направ лению и интенсивности дифрагированных пучков) в модель размещения атомов, на которых рассеялись пучки рентгеновских лучей, т. е. проблемы определе ния приближенной структуры рассеивающей материи. Часть III касается техники доведения приближенной структуры до той степени точности, которую могут обеспечить экспериментальные данные, а также вклю чает краткое описание некоторых дополнительных сведений, которые наряду с полной геометрией струк туры можно получить из современного структурного анализа. Большинство математических деталей выне сено в приложения.
При написании данной книги большую помощь оказали нам советы многих наших коллег, в частно сти Д. Аджея Веко, Елены Берман, Герберта Берн стайна, Керол Энн Касчиато, Энн Шомин, Джойс Даргей, Дэвида Айзенберга, Эмилии Мейврик, Уол тера Ореховского мл., Джоеля Суссмана и Дэвида Е. Захариаса. Мы благодарны им всем и особенно В. Дашевскому за то, что он взял на себя труд пе ревести эту книгу.
Филадельфия |
Дженни П. |
Гласкер |
Лос-Анджелес |
Кеннет Н. |
Трублад |
Июнь 1973 г. |
|
|
ПРИНЯТЫЕ ОБОЗНАЧЕНИЯ
— дополнительный неопре деленный знак (•+ или —), используемый при аналитическом опреде лении фаз в центро симметричной струк туре;
а— ширина дифракционной щели;
— амплитуды волн, прону
|
|
мерованных |
для |
удоб |
||||
|
|
ства |
индексами |
1, |
2 |
|||
|
|
и |
/. |
Результирующая |
||||
|
|
волна, |
получающаяся |
в |
||||
|
|
результате |
суммирова |
|||||
|
|
ния |
нескольких |
волн, |
||||
|
|
обозначена |
|
индек |
||||
А, В, A (hkl), В (hkl), Aj, Bj |
|
сом |
г\ |
|
| F | cos а |
|
||
— |
значения |
и |
||||||
|
|
| F | sin а соответствен- |
||||||
|
|
' но, т. е. компоненты |
||||||
|
|
структурного |
фактора |
|||||
|
|
F = |
А + |
£В. |
Нижний |
|||
|
|
индекс |
|
/' |
обозначает |
|||
А', В', А", В", Лм . Вм |
|
атом у; |
|
|
|
|
||
— значения Л и В, |
учиты |
|||||||
|
|
вающие Д/' (чтобы по |
||||||
|
|
лучить |
в |
результате |
А' |
|||
|
|
и В'), ДГ и ДГ |
(чтобы |
|||||
|
|
получить А" и В"), а |
||||||
|
|
также |
|
соответствую |
||||
|
|
щие значения для одно |
||||||
|
|
го |
аномально |
рассеи |
||||
|
|
вающего атома (Лм и |
||||||
|
|
Ям); |
осей |
элементар |
||||
а, Ь, с — длины |
||||||||
а, Ь, с — |
ной ячейки; |
|
|
|
||||
векторы |
элементарной |
|||||||
|
|
ячейки; |
|
|
|
|
||
а \ 6’ с* — длины |
ребер |
элементар |
||||||
|
|
ной |
ячейки |
в обратном |
||||
|
|
пространстве; |
|
|
10 |
Принятые обозначения |
|
|
|
|
|
|
|
||
|
а*, Ь*. с * - |
векторы |
элементарной |
|||||||
|
|
|
ячейки в обратном про |
|||||||
|
а, Ь, с, п, |
|
странстве; |
скольжения. |
||||||
|
d — плоскости |
|||||||||
|
|
|
Указано ребро, парал |
|||||||
|
|
|
лельное трансляции; |
|||||||
|
Abs — фактор поглощения; |
|||||||||
|
Biso |
изотропный |
температур |
|||||||
|
622. Ьзз, b12. 623. b3i, bnjbj — |
ный фактор; |
|
|
|
|||||
Ьи |
шесть |
|
температурных |
|||||||
|
|
|
параметров, |
|
представ |
|||||
|
|
|
ляющих |
изотропное теп |
||||||
|
|
|
ловое движение; допол |
|||||||
|
|
|
нительный индекс / со |
|||||||
|
|
|
ответствует |
атому |
/; |
|||||
|
|
C - |
комплексное число С = |
|||||||
|
|
C ' - |
= |
х + |
iy\ |
|
|
|
|
|
|
|
величина, комплексно со |
||||||||
|
|
|
пряженная С, где С* = |
|||||||
|
\ C \ - |
= |
x — iy; |
|
|
|
|
|||
|
модуль |
комплексного |
||||||||
|
|
|
числа: |
|С | = |
(СС*) ,/а= |
|||||
|
|
|
= № + у*)*; |
|
дву |
|||||
|
|
d — расстояние |
между |
|||||||
|
|
|
мя |
|
дифракционными |
|||||
|
|
|
щелями; |
|
|
|
|
|
||
|
dhkl. d — расстояние |
между |
пло |
|||||||
|
|
|
скостями |
(hkl) |
решетки |
|||||
|
E, ^н-К’ |
~ |
в |
кристалле; |
|
|
|
|||
|
значения |
F с поправкой |
||||||||
|
|
|
на |
эффекты |
теплового |
|||||
|
|
|
движения и фактор рас |
|||||||
|
|
|
сеяния. |
Н — K = h \ — |
||||||
|
|
|
— Ьг, |
|
— £2, |
l\ — h\ |
||||
|
F \hkl), |
|
К = /12, кг, |
1г\ |
|
|
||||
|
F — структурный фактор для |
|||||||||
|
|
|
отражения |
hkl |
элемен |
|||||
|
|
|
тарной ячейки. Он явля |
|||||||
|
|
|
ется отношением ампли |
|||||||
|
|
|
туды волны, |
рассеянной |
||||||
|
|
|
всем |
содержимым |
эле |
|||||
|
|
|
ментарной ячейки, к ам |
|||||||
|
|
|
плитуде волны, рассеян |
|||||||
|
|
|
ной одним |
электроном. |
||||||
|
|
|
Структурный |
|
фактор |
|||||
|
|
|
учитывает |
также |
фазо |
|||||
|
|
|
вый |
угол |
|
рассеянной |
||||
|
|
|
волны. F(000) равно пол |
|||||||
|
|
|
ному |
числу |
электронов |
|||||
|
|
|
в |
элементарной |
ячейке; |