Файл: Титаев А.А. Эволюция органических соединений на Земле. От углерода до биополимеров.pdf
ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 11.04.2024
Просмотров: 133
Скачиваний: 2
синтеза в смеси метана, аммиака и воды, служащим для конструи рования аминокислот [13 , 52, (541 и пуринов [38, (3*7f.
Механизм синтеза пуринов из синильной кислоты в модельных предбиологических системах состоял, как уже говорилось выше, в образовании вначале димера моноцианкарбена H2 N—С— CN, затем дипитрила амипомалоновой кислоты, далее производных имидазола 4-амипо-имидазол-5-карбоксамидина и 4-аминоимида- зол-5-карбоксамида наряду с такими веществами, как формамидин, формамид и др. (схема II,я. реакции 1, 2).
Эти вещества были выделены из реагирующей смеси и иденти фицированы [381. Далее удалось доказать, что адеиий образуется путем конденсации 4-амипо-имидазол-5-карбоксамидина с формамидином, а гуанин — конденсацией 4-аминоимидазол-5-карбокса- мида с гуанидином [38]. Представление об участии имидазольных
соединений |
в синтезе пуринов разделяется и другими исследова |
|||
телями [64, |
196]. |
|
|
|
Биосинтез пуринов совершается, по-видимому, сходными пу |
||||
тями, но он |
значительно сложнее |
их хемогенеза |
и начинается |
|
с амииироваиия рибозо-5-фосфата |
глутамином. |
Далее |
через |
|
ряд звеньев, в которых используются глицин, глутамин, |
аспара- |
|||
гиновая. кислота, С0 2 , формил, при |
участии ферментов, |
АТФ и |
тетра-гидрофолевой кислоты он приводит к образованию основного промежуточного вещества — 4-амино-имидазол-5-карбоксамида, который, как и в хемосинтезе, после присоединения формила и дегидратации превращается в пурин — инозиновую и затем в адениловую и гуаииловую кислоты [233, 234]. Из нескольких извест ных моделей предбиологического синтеза пиримидинов [см. стр. 78]. только в одной модели синтеза урацила из яблочной кислоты и мо чевины имеются некоторые черты сходства с биосинтезом пирими динов из С 0 2 и N H 3 через образование карбомоилфосфата (схема I I , б, реакция 3). Этот продукт вступает в реакцию с аспарагиновой кислотой, и затем полученный комплекс циклизуется в дигидрооротат, который через оротат и оротидин-5-фосфат превраща
ется в уридин-5-фосфат при участии рибозофосфата |
(схема |
I I , б, |
реакция 3) [234]. |
|
|
Весьма вероятно, что этим же путем из С0 2 , N H 3 , АТФ, |
при |
|
сутствовавших на Земле в предбиологическую эпоху, |
совершался |
и абиогенный синтез пиримидинов при участии каких-то катали заторов.
Что же касается полимеризации аминокислот и нуклеотидов с образованием белка и нуклеиновых кислот, то она совершалась, вероятно, по близкому механизму как в абиогенезе,. так и при биосинтезе. Так, полимеризация аминокислот в том и другом процессе шла по закономерностям образования пептидных связей ( —СО —N11—). Средствами для достижения этой цели в абиогенезе были АТФ, адсорбенты, катализаторы. В процессе биосинтеза бел ка принимают участие АТФ, РНК, ферменты. В основном сходство
5 А. А. Титаев |
113 |
путей того и другого процесса несомненное, но в частностях — значительные различия.
Совершенно то же самое можно сказать и о сходстве синтеза полинуклеотидов в добиологический период с процессом биосинтеза их в настоящее время: основные химические закономерности син теза остаются неизменными, средства для достижения результата глубоко различны. Основная целенаправленность биосинтеза белка и нуклеиновых кислот состоит в получении упорядоченной, закрепляемой наследственно структуры. Информация для белка считывается при этом с РНК, для РНК — с ДНК, ДНК же спо собно к репликации.
Структура белка и нуклеиновых кислот, получаемых и полу чавшихся в свое время абиогенным путем, не может быть хаотич ной. Она определенным образом упорядочена, и эта упорядочен ность диктуется химическими закономерностями строения амино кислот и нуклеиновых оснований [1481.
В силу этого в структуре макромолекул сохраняется какой-то наследственный порядок, причем информация идет через прямое воздействие среды [235].
Примером сходства предбиологического синтеза с биосинтезом может служить модельная реакция образования порфириноподобного вещества путем конденсации глицина и янтарной кислоты в присутствии глины и восстановленного глютатиоиа. Той же цели можно достигнуть, пользуясь 6-аминолевулиновой кислотой".
2СООН • СНоСЫо • СООН+2СН2 • NH2 • СООН-.СООН • С Из • СН» • СО • СН3 • N H 3 z 2 ? °
Янтарная кислота |
Глицпн |
S - Лмиполевулнповая кислота |
|
HOOC-HiC |
СНа—СШ-СООН |
|
|
I |
I |
|
|
-*С—С -» Порфирип |
|
|
|
I! |
II |
|
|
ССН
Н3 С/\/-NH
I
Nr/b
Порфобилиноген
Биосинтез порфириновых веществ (порфобилиногена) совер шается путем конденсации глицина с ацетатом или с янтарной кислотой. Ацетат при этом проходит через цикл Кребса в форме ацетил-КоА, превращаясь в сукцииил-КоА. Если исходным ве ществом служит янтарная кислота, то она тоже активируется с образованием сукцинил-КоА. Сукцинил-КоА далее превращается в б-аминолевулииовую кислоту, которая в свою очередь пре вращается при содействии фермента синтетазы в порфобили ноген.
114
По данным Шемииа и сотр. [122, 123], 6-аминолевулиновая ки слота — единственный источник протопорфирииа в организме.
|
О |
|
|
II |
|
СНзСООН -|- АТФ + |
I-IS • КоА — СЩС—S • КоА 4- АМФ 4- ФФн |
|
О |
цг |
О |
п |
il |
|
СНзС—S-KoA — i СООН-СНзСНг-С—S-KoA |
||
|
Сукцинил - ЕоА |
|
0 |
ПФ |
|
II |
I |
|
СООН • СНа • О Ь • С—S • КоА 4- CHsNHsCOOH-^ СООН • СНа • СН2СО • СНа • Nl-b
Глицин
Порфобилппогеи —> Порфнрин
Сходный механизм синтеза порфириновых веществ можно пред полагать и в модельных опытах, где активирование конденсируе мых молекул осуществляется возможным аналогом КоА — ком плексом глины с глютатиоиом — SH.
В предбиологических условиях (модельных) порфириноподобные вещества были синтезированы также из пиррола и бензальдегида [124]. Но они могли синтезироваться и из пиррола и формаль дегида. Эти аутокаталитические процессы требуют обязательного присутствия воды и кислорода и состоят, вероятно, в прямой кон денсации пиррола в тетрапиррол.
Наиболее отличен от биосинтеза предполагаемый хемосинтез углеводов. В предбиологическую эпоху он мог идти тем путем; который указан в модельных опытах: метан ->• формальдегид->- сахар (стр. 94).
Возможен и другой путь [6]:
СОз 4- НзО -* формальдегид —» сахар.
В современных растениях образование углеводов совершается
путем фотосинтеза из С 0 2 и Н 2 0 при участии хлорофилла и света |
|
[2361: |
6СО* + б&О 4- 6 n h v ^ * S СвНиО. 4- 60s. |
|
|
|
Ферменты |
Механизм фотосинтеза сложен. Вначале происходит под действием света фотолиз воды с образованием свободного кислорода и восста
новителя. Углекислый газ |
не расщепляется, но присоединяется |
к уже предобразованпому |
углеводу — рибозе с образованием за |
тем глюкозо-6-фосфата. Этот процесс, как видно, не имеет ничего общего с первичным хемосинтезом углеводов. Имел ли фотосинтез в своем развитии в процессе химической эволюции корни в хемо синтезе, сказать нельзя, так как пути развития фотосинтеза на Земле неизвестны. Гафрон считает, что могли существовать какие-
115 |
5* |
то промежуточные формы фотосинтеза, с использованием иных пигментов, чем хлорофилл [1261.
В нефотосинтезирующих организмах (бактериях, животных) источником для синтеза углеводов может служить пировиноградиая кислота, что доказано методом меченых атомов [237, 2381. В микроорганизмах существует еще глиоксилатный цикл синтеза углеводов [2391. В этом цикле уксусная кислота реагирует с глиоксиловой кислотой при участии КоА с образованием малата и по следовательного ряда кислот цикла Кребса. Результатом реакции является образование одной молекулы янтарной кислоты из двух молекул ацетата. Янтарная кислота через фосфоенолпируват пре вращается в глюкозо-6-фосфат. Указанные здесь исходные веще ства (уксусная, янтарная, глноксиловая кислоты) могли присут ствовать среди продуктов абиогенного синтеза [64, 65, 192]. Могли ли они превращаться в этих условиях в глюкозу, неизвестно.
В отношении хемосинтеза и биосинтеза дисахаридов и полиса харидов дело обстоит лучше: здесь имеются общие черты.
Хемосинтез дисахаридов в абиогенных условиях был выполнен в условиях адсорбции на белой глине в присутствии восстановлен ного глютатиоиа из глюкозы и фруктозы. Полимеризация глюкозы в крахмал происходила в тех же условиях, с некоторыми модифи кациями. Систему глина —восстановленный глготатион можно рассматривать как комплексный катализатор, напоминающий тиоловые ферменты.
Биосинтез дисахаридов в растениях совершается легко и бы стро, главным образом из уридиндифосфат-глюкозы и фруктозы при участии фермента трансгликозилазы [218]. Существует и дру гой путь синтеза дисахаридов — из глюкозо-1-фосфата и фрукто зы при участии сахарозофосфорилазы. Но этот путь менее эффек тивен.
Синтез полисахаридов идет по этим же двум путям или же пу тем конденсации мальтозы и декстрина при участии аденозинфосфатглюкозы [219].
Между абиогенным синтезом и биосинтезом дисахаридов и полисахаридов можно усмотреть сходство в начальных и конеч ных продуктах. Возможно, существует сходство и в промежуточ ных стадиях, если рассматривать глину с восстановленным глютатионом как протофермепт.
В отношении абиогенного синтеза жирных кислот и их биосин теза можно видеть также большое сходство. Как абиогенный синтез, так и биосинтез совершаются путем конденсации ацетата, в первом случае в присутствии некоей модели КоА—SH, во вто ром случае в присутствии натурального КоА—SH. Механизм полимеризации уксусных остатков в том и другом случае должен быть, по-видимому, аналогичен.
Итак, общее аналитическое сравнение абиогенных синтезов с процессами биосинтеза позволяет найти в них некоторые общие стороны.
116
К сожалению, сведений о механизмах абиогенетических реак ций еще мало, приходится ограничиваться лишь предположениями и логическими умозаключениями. Поэтому углубленное сравнение процессов абиогенеза и биосинтеза с позиций тонкого строения соединений в ряде случаев пока невозможно. Начальные пути химической эволюции не повторяются в биогенезе биополимеров. Первичные вещества СН4 , НСНО, HCN, N H 3 были в значительной мере использованы, и их остатки исчезли с лица Земли. Оставаясь, они могли бы лишь задержать развитие живого мира в силу своей ядовитости. Интересно обратить внимание на то, что в модельных синтезах микромолекул из первичпых веществ метана, НСНО, HCN (см. схему II) образуются в качестве промежуточных продук тов жирные кислоты, пиримидииы же и порфирииы синтезированы непосредственно из жирных кислот. Не являлись ли жирные кислоты ключевым веществами для синтеза биополимеров? Они Же в качестве уже исходных веществ используются и в процессе биосинтеза.
Так или иначе, только конечные этапы предбиологических синтезов сходны с путями биосинтеза. Можно сказать, что био синтез повторяет конечные этапы первичного хемосинтеза и что существует некая генетическая связь между химической и биоло гической эволюцией.
Сравнение путей хемосинтеза с путями биосинтеза показывает лишь общность химических реакций в том и другом. Глубокое раз личие между этими процессами заключается главным образом в. характере используемых катализаторов — специфических фермен тов в биосинтезе, разных неспецифических каталитических систем в хемосинтезе. Это различие сказывается преимущественно на скорости реакции, но может сказаться и на некоторых деталях строения синтезируемого продукта.
Заключение
Начало химической эволюции на Земле логично отнести к моменту возникновения иа ней первых соединений углерода с водородом — метана, с азотом — циана. Это могло произойти еще в пору звезд ного состояния Земли. Тогда же или несколько позже на Зедгле образовались неорганические соединения, в том числе аммиак и вода. Далее, по мере остывания земной коры, из метана и циана при взаимодействии с аммиаком и водой могли образоваться бес численные органические соединения с разнообразными структу рой и свойствами. Вероятно, это был химический «хаос», сочета ние синтеза и разрушения. В дальнейшем химической эволюции подверглась лишь часть этих веществ: закономерности строения и взаимодействия веществ создали порядок в этом хаосе, опреде лили направление химической эволюции. По словам Бернала, руководящей силой химической эволюции иа Земле была само реализация потенциальных возможностей электронных состоя нии атомов [49].
Углерод, азот, кислород, сера, фосфор — основные элементы живого организма — отличаются от других химических элемен тов способностью легко образовывать кратные связи. В соедине ниях с одинарной связью эти элементы содержат иеподеленную пару электронов, которая обладает свойством к делокализации и может связывать сопряженные участки в белках, ферментах, нуклеиновых кислотах. Такие сопряженные связи, обусловлен ные делокализацией электронов, характерны для этих жизнено важных соединений, от них зависят основные проявления жизни.
Известно, что образование химических соединений, образова ние стабильных ковалеитных связей между атомами в общем смы сле зависит от снижения виртуальной кинетической энергии. Это явление в свою очередь определяется интерференцией атомных орбит, занятых одними и теми же электронами, взаимным проник новением электронных орбит, принадлежащих разным атомам, переносом заряда, электростатическими взаимодействиями атомов.
Характерные свойства атомов (структура) неизбежно реализу ются в преимущественном образовании определенных соединений из углерода и водорода — углеводородов, из водорода и кислоро да — воды и т. д.
118