Файл: Новые методы анализа аминокислот, пептидов и белков..pdf

ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 14.10.2024

Просмотров: 113

Скачиваний: 0

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

454

ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ

-------синтетические 297, 301, 302, 304

аппаратура 302—305, 318, 314— 318

на бумаге 336

время 312, 328—331

градиент плотности, рабочие рас­

творы 311, 319, 320

 

326,

градиент pH

297, 302, 306,

328, 336

 

 

 

-------естественный 300, 336

 

-------искусственный 300, 336

 

-------линейный 302

 

 

диапазон pH 304, 309

 

 

зонное конвекционное 319

 

измерение pH

305, 308, 324

 

в изоточке

белков

агрегация

320

 

319—321,

-------определение 308,

335

 

 

 

-------осаждение 309, 312, 318

 

методика 306—309, 324—327

 

напряженность поля 312

 

область применения 314—320

 

определение 298, 299

 

302,

полиакриламидный гель 297,

321—328

 

 

 

преимущества метода 339 размывание образца 310

разрешение 300, 301, 310, 312, 319, 327, 335, 336, 339

слив колонки 308, 312 смеситель для формирования

градиента плотности 305, 307 спектры разделения 332 сущность метода 298, 299, 337

теория 299, 300

в тонком слое 269 электродные растворы 306, 325,

329

Электрофокусирование 320—339 в геле, аппаратура 322—324, 332

время 328—330

градиент pH 324, 328, 330

измерение pH 324, 326

методика 324—327

нанесение образца 325, 327

обнаружение белков 331

окрашивание 326

полимеризация 325, 327, 328

препаративное разделение 335, 336

применение 334

разрезание геля 324

разрешение зон 332, 335

регистрация 327

сопоставление зон 332, 333

— сочетание t электрофорезом в геле 337—339

----------- в градиенте плотности геля 338

строение геля (химическое) 324

удаление амфолитов-носите­ лей 326

электролиты у катода и анода

325, 329

вградиенте плотности 297, 301— 320

-------аппаратура 302—305, 318

------- внесение образца 310

-------детектирование 313, 314

-------диапазон pH 309

-------композиция 309, 320

-------концентрация амфолитовносителей 309

-------методика 306—308

-------применение 314—320

-------разрешение 300, 301, 312, 319

------- температура 308 Электрофорез, см. также Диск-элек-

трофорез; Иммуноэлектрофорез; Микроэлектрофорез

Электрофорез в геле (см. также Диск-электрофорез; Электрофоку­ сирование в геле) 277—294

арагозы, содержащей антитела

274, 275

в градиенте плотности 338 сочетание с электрофокусирова­

нием в геле 337

втонком слое, аномальная мигра­ ция 268—272

------- аппаратура 270

-------перенос образца 271, 272

-------сочетание с гель-фильтра­ цией 268—271

молекулярно-весовое распределе­ ние 419—423

полиакриламидного геля с на-

трийдодецилсульфатом 411, 414, 419—423

соотношение: электрофоретиче­ ская подвижность — молекуляр­

ный вес 419, 420

сочетание с гель-фильтрацией

268—27.1, 274, 275

Эллмана реагент 366

Энцефалит, подострый склерозирую­ щий 271, 274

Эндоосмос 284, 301, 328, 336,

Энниатин 211 Энолаза 392



ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ

455

Эритрокруорин 398, 399 Эсперин 224—225

Эс-традиол-связывающий р-глобулин

316

Этерификация аминокислот, пептидов в активном центре ферментов 369 диазометаном 106, 147, 148 диметилсульфитом 105 Катионообменные катализаторы

106

методика для аминокислот 114 спирты и кислые катализаторы

103, 104, 114, 128, 132, 135, 147

тионилхлорид 94 N-Этилмалеинимид 366, 379

Янга тест 174

Янтарный ангидрид 37?

СОДЕРЖАНИЕ

Предисловие

.......................................................................................................

 

 

 

 

 

 

 

 

б

Из предисловия к английскому изданию...................................................

 

 

8

Глава 1.

ХРОМАТОГРАФИЧЕСКИЙ

АНАЛИЗАМИНОКИС­

 

 

ЛОТ И ПЕПТИДОВ НА СФЕРИЧЕСКИХ СМОЛАХ

 

 

И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ В БИОХИМИИ И МЕДИ­

 

 

ЦИНЕ . Дж .

В.

Бенсон мл.,

Дж. А. Патерсон . . . .

9

1.1.

Применение

метода..............................................................

 

 

 

9

1.1.1.

Применение в биохимии ....................................................

 

 

10

1.1.2.

Применение в медицине ....................................................

 

 

11

1.2.

Хроматографические системы ...........................................

 

18

1.2.1.

Одноколоночные

методы.....................................................

 

 

18

1.2.2.

Двухколоночные

методы.....................................................

 

 

19

1.2.3 ......................................

Смолы

 

 

 

 

 

 

 

 

20

1.2.4.

Хроматографические колонки ...........................................

 

22

1.2.5. .....................................................

Элюирующие ж идкости

 

 

23

1.2.6. .............................................................................

Д етекторы

 

 

 

колонки . . . ....................

26

1.2.7.

Контроль температуры

30

1.2.8. ........................................................................

Автоматизация

 

 

 

 

 

30

1.3. .....................................................

Методы

хроматографии

 

 

33

1.3.1. .....................................................................................

Методы

 

 

 

 

 

 

 

 

33

1.3.2. .....................................................

Катионообменные смолы

 

 

34

1.3.3. .....................................................

Анионообменные см о л ы

 

 

37

1.3.4. .................................................

Лигандная

хроматография

 

37

1.3.5.

Гидролиз пептидов в потоке жидкости . . . . . .

38

1.4. ...................

Факторы , влияющие на качество анализа

39

1.4.1. ..........................................................

Приготовление

пробы

 

 

 

39

1.4.2. ..............................................................

Заполнение колонки

буфера

'

40

1.4.3. ................... ....................

Влияние величины pH

41

1.4.4 .............................

Влияние концентрации

ионов натрия

43

1.4.5 .............................

Влияние концентрации цитрат - ионов

44

1.4.6 ..........................................................

Влияние

температуры

 

 

 

45

1.5. ....................................................

Расчет площадей

пиков

 

 

47

1.5.1. ...............................................................

Разрешение

п и к о в

 

п р о б ы

 

47

1.5.2 ...................................

Определение

концентрации

 

48

1.6. ................................................

Рекомендуемые

 

методики

 

50

1.6.1. ..............................................................

Подготовка

п р о б ы

 

растворов

50

1.6.2. .............................

Приготовление

буферных

52

1.6.3. ......................................................

Нингидриновый

 

реагент

 

 

53

1.6.4. ...................

Методика

анализа

белковых гидролизатов

55

1.6.5.

Методика

анализа

физиологических

жидкостей . . .

61

1.6.6.Ускоренный одноколоночный метод анализа белковых

гидролизатов.........................

70


СОДЕРЖАНИЕ

457

1.6.7.Анализ отдельных аминокислот . .

1.6.8.

Соединения, содержащие селен . .

1.6.9.Методика разделения смесей пептидов Список литературы.............................

Глава 2.

ГАЗОВАЯ

ХРОМАТОГРАФИЯ АМИНОКИСЛОТ.

 

 

Дж. Р. Коултер, К. С. Ханн . .......................................

85

2. 1.

Введение

..................................................................................

85

2.2.

Методы, имеющие исторический или исследователь­

 

 

ский интерес, а также методы специального применения

88

2 .2 . 1.

Окисление

нингидрином . ................................................

88

2.2.2.

Метиловые эфиры а-хлораминокислот.............................

89

2.2.3.Метиловые эфиры 2,4-динитрофениламинокислот . . . 89

Фенилтиогидантоины аминокислот................................. 902.2.4.

2.2.5.

Метиловые эфиры N.N-диметиламинокислот . . . .

90

2.2. 6.

а-Оксиаминокислоты..........................................................

91

2.2.7.Метиловые эфиры N-диэтилфосфатов аминокислот . . 91

Эфиры алкилиден- и алкиламинокислот........................ 922.2.8.

2.2.9.

Иодсодержащие аминокислоты...........................................

 

92

2.2.10.

Сульфо- и

селеноаминокислоты......................................

 

94

2 .2. 11.

Разделение

стереоизомеров................................................

 

96

2.2.12.

Методы единичного, ограниченного или недавно пред­

 

 

ложенного применения .........................................................

 

99

2.3.

Триметилсилиламинокислоты ..............................................

 

100

2.3.1.

Силилирование с помощью ТМХС, ГМДС и ТМС-ДЭА

100

2.3.2.

Силилирование силиламидами ...........................................

 

101

2.3.3.

ГХ анализ ТМС-аминокислот...........................................

 

102

2.4.

Общие методы: эфиры ацилированных аминокислот

103

2.4.1.

Этерификация карбоксильных групп.......................

• .

104

2.4.2.Получение эфиров аминокислот в виде свободных ос­

 

нований ..................................................................................

106

2.4.3.

Ацилирование амино- и других функциональных групп

107

2.4.4.Превращение аргинина в орнитин и гистидина в аспа­

 

рагиновую кислоту ...............................................................

112

2.4.5.

Устойчивость ацилированных аминокислот ...................

114

2.4.6.

Выбор эфиров ациламинокислоТ для Г Х ........................

115

2.4.7.Носители, жидкие фазы и способы разделения эфиров

ациламинокислот методом Г Х ...........................................

117

2.4.8.Количественное определение н-пропиловых эфиров аце-

тиламинокислот ...................................................................

127

2.4.9.ГХ-анализ белковых и пептидных Гидролизатов . . . 130

2.5.

2.6.

2.6.1.

2.6.2.

Заключение............................................................................

131

Используемые в тексте сокращения................... ....

. 133

Общие......................................................................................

133

Реагенты и группы ............................................... ....

133

2.6.3.Термины газовой хроматографий и Жидкие фазы . . 133

2.7.

Приложение ......................................

 

134

2.7.1.

Носители и жидкие фазы............................ .......................

 

134

2.7.2.

Эфиры ацилированных аминокислот.............................

 

135

2.7.3.

Гистидин ..................................................................................

. . . .

135

2.7.4.

Озонолиз гистидина ...........................................

136

2.7.5.

Комбинированная ГХ-масс-спектрометрия....................

. . .

136

2.7.6.

ТМС-аминокислоты................................................

136

2.7.7.

Иодаминокислоты..................................................................

 

137

 

Список литературы..............................................................

 

137


СОДЕРЖАНИЕ

ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ ПЕПТИДОВ. Б. Кольб

Введение .................................................................................

 

 

 

 

 

142

Получение летучих производных......................................

 

 

146

Защита аминогруппы.........................................................

 

 

 

147

Защита

карбоксильной груп пы ......................................

 

 

147

Защитные группы для третьей функциональной груп­

148

пировки

 

 

 

 

>

Аппаратура

...................................................................

 

 

 

149

Колонки

 

 

 

 

 

149

Детекторы .............................................................................

данных

 

 

 

154

Публикация

 

 

 

 

156

Относительное

время удерживания.................................

 

 

156

Система

индексов удерживания .......................................

 

 

159

Применение ГЖХ для анализа последовательности

165

аминокислот.....................................

 

.... .................................

 

 

Анализ последовательности с помощью комбинации

 

методов газовой хроматографии и масс-спектрометрии

168

Разделение

диастереомеров ..............................................

 

 

Дипептидный

т е с т ...............................................................

 

 

 

171

Трипептидный

т е с т ...............................................................

 

 

 

175

Приложение

к специальным задачам.............................

 

 

178

Анализ пептидов пиролитической газовой хроматогра­

179

фией

 

 

 

 

Дополнение ............................. .......................................

 

 

 

 

182

Определение .................................данных удерживания

 

 

182

Вычисление .................................

времени пика

воздуха

 

 

183

Определение .............................

индексов удерживания

 

 

184

Список ..............................................................

литературы

 

 

 

186

МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ В ХИМИИ ПЕПТИДОВ.

 

Б. Ц. Дас ........................................................., Э. Ледерер

 

 

 

189-

Введение........................................... ..................................

 

 

 

 

'189

Методы химической модификации пептидов перед их

189

Масс-спектрометрированием................................................

 

 

Полиаминоспирты..................................................................

 

 

 

190

Эфиры ...........................................

N - ацилолигопептидов

 

 

191

Основные пути фрагментации пептидов и их произ­

192

водных ....................................................................................

 

пептидной

с в я з и

 

 

Фрагментация ......................................

 

 

192

Фрагментация ................................................С—СО-связи

 

 

193

Фрагментация ...........................................боковых ц еп ей

 

в

194

Определение

аминокислотной последовательности

198

эфирах .................................

N - ацилпептидов

.

, ,

,

Природные ................................................

пептидолипиды

 

 

200

Синтетические ............................................- гликопептиды

 

 

208

Циклические ..........................................................

пептиды

 

 

 

208

Депсипептиды.......................................................................

 

, .

.

211

О, N-Перметилирование производных пептидов

212

Замечания к методике перметилирования . . . . . .

.

216

Аминокислоты, определение которых осложнено . .

217

Обнаружение

природных

N-метиламинокислот . .

.

219

Масс-спектрометрическое определение последователь­

220

ности производных перметилированных пептидов .

.

Пептидные ....................................................

антибиотики

 

, .

,

220

Олигопептиды, полученные деградацией белков

225