Файл: Новые методы анализа аминокислот, пептидов и белков..pdf
ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 14.10.2024
Просмотров: 157
Скачиваний: 0
154 |
ГЛАВА 3 |
ными для разделения диастереомеров [20, 22]. Для более общего применения, включающего целый набор аминокислот и дипептидов, вышеупомянутые высокотемпературные силиконы могут быть полезны в работе с капиллярными колонками, особенно в режиме с программированием температуры, как это указано на рис. 1. Данный капилляр со смешанной жидкой фазой из диметилсиликона OV-101 и карбовакса 20М был изготовлен для лучшего разделения различных классов аминокислот, дипептидов и трипептидов. По имеющимся наблюдениям небольшое количе ство сильнополярного вещества (такого, как полигликоль), сме шанного с неполярной жидкой фазой (например, OV-101), при водит к увеличивающемуся сдвигу между классом дипептидов и трипептидами в сторону больших времен удерживания. Этот эффект особенно ценен в той части пептидной хроматограммы, где дипептиды смешаны с трипептидами, потому что группа трипептидов целиком может быть отделена от дипептидов для облегчения идентификации последних. Эффект можно обнару жить на приводимом (см. рис. 1) примере разделения амино кислоты фенилаланина и дипептида А1а-А1а; с чистым диметилсиликоном OV-101 дипептид элюировался бы перед упомянутой аминокислотой. Именно в этой области при неполярной жидкой фазе перекрываются аминокислоты и дипептиды. Вероятно, тот же эффект можно было получить с одним из высокотемператур ных силиконов умеренной полярности, однако для их примене ния требуются дальнейшие исследования. Хроматограмма на рис. 1 является демонстрацией возможных преимуществ стек лянной капиллярной колонки с высокотемпературной силико новой жидкой фазой и программированием температуры.
3.3.2.Детекторы
Для указанных целей достаточно использования обычных для ГЖХ детекторв, а именно пламенно-ионизационного детек тора (ПИД) и детектора с нагреваемой нитью (ДНН). ПИД применяется для малонагруженных набивных и капиллярных колонок из-за их низкой емкости, тогда как ДНН можно исполь зовать только для сильнонагруженных колонок. Электроноза хватный детектор (ЭЗД) не применялся для газохроматографи ческого анализа производных пептидов. В этом случае в отличие от производных аминокислот применение ЭЗД ограничено из-за неизбежно высокой температуры колонки и связанной с этим опасностью загрязнения детектора в результате утечки фазы с колонки, влияющей на интенсивность сигнала и чувствитель ность. Тем не менее гептафторбутирилпроизводные могли бы оказаться полезными вследствие их большей летучести и высо кого сродства к электрону.
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ ПЕПТИДОВ |
155 |
О |
10 |
20 30 40 |
50 |
ВО |
70 80 |
90 |
100 |
|
|
Время, |
мин |
Изотермический |
|
||
|
|
2,5 С/мин |
|
|
|
||
н |
|
|
и |
резким |
|
н |
|
|
|
|
--------------- |
|
|||
130°С |
|
|
280°С |
280°С |
|||
Рис. 3. Газохроматографическое |
разделение |
N-ТФА-метиловых |
эфиров |
||||
|
|
аминокислот и дипептидов. |
|
|
|||
Прибор марки |
«Perkin-EImer Model 270 GC—DF>—масс-спектрометр; колонка: 3,64м*3,3мм |
||||||
из нержа*веющей стали, |
содержащая 536SE-30 на |
носителе хромосорб |
G, п. к.,—ДМХС |
||||
80/100 меш: газ-носитель |
гелий, скорость потока 30 мл/мин, отношение разделяемых пото |
||||||
ков'после колонки 1 :3, |
меньшая часть направляется на молекулярный сепаратор; тем |
||||||
пература программируется, как указано; детектор: датчик полного ионного |
тока. |
/ —Met, 2—Phe, 3—Leu-Ala (LL + DL), 4—Val-Val (LL), 5—Val-Val (DL), 5—Рго-Val (LL), 7—Ala-Phe (LL), 3—Ala-Phe (DL), 9— Phe-Phe (LL), /0 —Phe-Phe (DL).
Самым универсальным детектором, no-видимому, является, масс-спектрометр, который может считаться детектором для ГЖХ, если колонка непосредственно соединена с масс-спектро метром при помощи молекулярного сепаратора (см. также разд. 3.5.1). На таком приборе газовая хроматограмма реги стрируется датчиком полного ионного тока, как показано на рис. 3, в то же время масс-спектр может сканироваться от каж дого интересующего пика. Однако из-за чрезмерной утечки жидкой фазы с колонки при повышенных температурах, дающей
156 |
ГЛАВА 3 |
в масс-спектре сильный фон, непосредственная комбинация ме тодов ограничивается исследованиями низших пептидов и в меньшей степени пригодна для изучения более длинных пепти дов при тех высоких температурах, которые необходимы для газохроматографического разделения. По этой причине метод улавливания соединений после колонки с целью дальнейшего масс-спектрометрического исследования кажется более удобным для высших пептидов, например три- и тетрапептидов. Недавно Байер и Кёниг [18] сообщили о применении комбинированного прибора газовый хроматограф — масс-спектрометр для разделе ния пептидных производных, но, вероятно, из-за обсуждавшихся выше трудностей приведенные масс-спектры сканировались с использованием системы прямого ввода прибора.
3.4.ПУБЛИКАЦИЯ ДАННЫХ
Данные по удерживанию должны быть представлены таким образом, чтобы их можно было пересчитывать для опытов с другими приборами и условиями. Можно получить абсолютные величины путем измерения коэффициентов распределения или удельного удерживаемого объема, однако для практических це лей данные удерживания приводят главным образом в относи тельном виде — либо измеряют удерживание по отношению к стандартному веществу, либо измеряют индексы удерживания по отношению к гомологическому ряду к-алканов (см. разд. 3.9).
3.4.1.Относительное время удерживания
Чтобы определить относительные времена удерживания в ряду соединений, нужно выбрать стандарт, время удерживания которого является приблизительно средним для данного ряда. Для возможности сравнения результатов разных лабораторий и во-избежание пересчетов следует в качестве стандарта исполь зовать одно и«то же вещество. К счастью, все имеющиеся в ли тературе относительные времена удерживания метиловых эфи ров N-ТФА-дипептидов даны по отношению к метиловому эфиру миристйновой кислоты; более того, все измерения проводились в сходных условиях на колонках с высоким содержанием сили конового масла.
Относительные времена удерживания метиловых эфиров N-ТФА-дипептидов измерены в лаборатории Вейганда [10, 17, 23], а также Томидой и сотр. [24]. Результаты собраны в табл. 1, 2 и 3. В табл. 1 относительные времена удерживания вычислены для колонок с диметилсиликоновой жидкой фазой, с тем отли чием, что некоторые величины вычислены на основании приве денного времени удерживания, измеренного по времени пика
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ ПЕПТИДОВ |
157 |
Таблица 2
ОТНОСИТЕЛЬНОЕ ВРЕМЯ УДЕРЖИВАНИЯ ТРИМЕТИЛСИЛИЛЬНЫХ ЭФИРНЫХ ПРОИЗВОДНЫХ МЕТИЛОВЫХ ЭФИРОВ N-ТФА-ДИПЕПТИДОВ НА АПИЕЗОНОВОИ СМАЗКЕ. (ОТНОСИТЕЛЬНОЕ ВРЕМЯ УДЕРЖИВАНИЯ МЕТИЛОВОГО ЭФИРА МИРИСТИНОВОЙ КИСЛОТЫ ПРИНЯТО РАВНЫМ 1,00 [17])
|
|
Относительное время удерживания |
|
|
|
Соединение |
190 °C |
201 °C |
210 °C |
222 °C |
|
|
|
||||
T M S - L - S e r - L - A l a |
0,26 |
0.27 |
0,28 |
0,29 |
|
T M S - L - S e r - L - V a l |
0,41 |
0,42 |
0,43 |
0,43 |
|
T M S - L - S e r - L - L e u |
0.54 |
0,54 |
0,54 |
0.54 |
■ |
T M S - L - S e r - L - I l e |
0 59 |
0,59 |
0,59 |
0,58 |
|
T M S - L - S e r - L - P r o |
0,76 |
0,76 |
0,76 |
0,75 |
|
T M S - L - S e r - L - M e t |
— |
1,80 |
1,72 |
1,62 |
|
T M S - L - S e r - L - P h e |
— |
2,73 |
2,63 |
2,44 |
|
T M S - L - T h r - L - A l a |
0,23 |
0,24 |
0,25 |
0,26 |
|
T M S - L - T h r - L - V a l |
0,36 |
0.37 |
0,37 |
0,39 |
|
T M S - L - T h r - L - L e u |
0,46 |
0.47 |
0,47 |
0.48 |
|
T M S - L - T h r - L - I l e |
0.52 |
0,52 |
0,52 |
0.53 |
|
T M S - L - T h r - L - P r o |
0.73 |
0.73 |
0,73 |
0,73 |
|
T M S - L - T h r - L - M e t |
— |
1.52 |
1,47 |
1,40 |
|
T M S - L - T h r - L - P h e |
“ |
2,31 |
2,22 |
2,09 |
|
Таблица 3
ОТНОСИТЕЛЬНОЕ ВРЕМЯ УДЕРЖИВАНИЯ ДИКЕТОПИПЕРАЗИНОВ НА ДИМЕТИЛСИЛИКОНОВОИ ЖИДКОЙ ФАЗЕ (ОТНОСИТЕЛЬНОЕ ВРЕМЯ УДЕРЖИВАНИЯ МЕТИЛОВОГО ЭФИРА МИРИСТИНОВОЙ КИСЛОТЫ = 1,00 [17])
Соединение |
Относительное время |
удерживания, 225 °С |
|
Ангидрид DL-валина |
0,44 |
Ангидрид L-Pro-L-Leu |
1,96 |
Ангидрид L-Ala-L-Phe |
3.92 |
Ангидрид саркозина |
0,48 |
воздуха, тогда как другие рассчитаны на основании полного вре мени удерживания, измеряемого от момента ввода пробы. Имен но по этой причине цифры выше при низких значениях и ниже — при высоких, чем вычисленные на основании приведенных времен удерживания. Относительные времена удерживания всегда нуж но рассчитывать по приведенным временам удерживания, а если время пика воздуха нельзя измерить из-за использования пла менного детектора, его нужно рассчитывать (см. разд. 3.9). От клонения, однако, могут лежать в пределах точности измерений,
158 |
ГЛАВА 3 |
так как по ряду причин относительные времена удерживания, полученные в разных лабораториях, трудно воспроизвести. Эти характеристики сильно зависят от температуры, однако во мно гих продажных образцах приборов последнего поколения конст рукция печи недостаточно хороша в отношении градиентов тем пературы по колонке и точности записи температуры при ис пользовании термопар. Кроме температуры, на относительные времена удерживания могут влиять материалы колонки из-за различий в активностях носителей и химических свойствах жидкой фазы, не принадлежащей одной партии реагентов. Из вестно, что на относительное время удерживания полярного сое динения в некоторой степени могут оказывать влияние даже условия предыдущего использования колонки. С учетом этих ограничений рассмотрение данных табл. 1 свидетельствует об удовлетворительном соответствии значений, полученных в двух лабораториях.
Соединения табл. 1 перечисляются таким образом, что при постоянной N-концевой аминокислоте ак варьируется аминокис лота х с концевой карбоксильной группой, что дает ряды дипеп тидов ак-х. Сразу же можно заметить, что порядок С-коицевых аминокислот х одинаков для каждого ряда. Более того, в каж дом ряду сдвиг соединений характеризуется довольно постоян ным фактором. Это дает основание распространить систему от носительных времен удерживания на другие дипептиды, относи тельные времена удерживания которых еще не измерялись, при условии, что в качестве стандарта доступно по крайней мере по одному соединению каждого ряда. Вейганд, Кольб и Кирхнер
[23], а позднее также и Томида, Токуда, Охаши и Накаджима
[24]использовали для подобных расчетов соответствующий гра фик. Эта система, однако, проще объясняется с помощью индек сов удерживания и будет рассмотрена позже. В табл. 2 собраны некоторые триметилсилильные эфирные производные метиловых эфиров N-ТФА-дипептидов, разделявшихся с апиезоновой смаз кой в качестве жидкой фазы.
При комбинации двух аминокислот могут получиться не только дипептиды, но также и дикетопиперазины, которые тоже обнаруживались в частичных гидролизатах [6]. В результате воз никают трудности в анализе хроматограммы, так как дикетопи перазины выходят вместе с метиловыми эфирами N-ТФА-дипеп тидов. В табл. 3 приведены относительные времена удержива ния некоторых дикетопиперазинов, измеренные в условиях, со поставимых с условиями относительных времен удерживания метиловых эфиров N-ТФА-дипептидов в табл. 1.
Уэстли, Клоуз, Нитеки и Хальперн [25] сообщили о газохро матографическом разделении 13 дикетопиперазинов, которые, однако, не включены в табл. 3. Данные по удерживанию были