ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 15.10.2024
Просмотров: 163
Скачиваний: 0
атом*кольца. Впрочем, с подобной ситуацией мы уже встречались при обсуждении конформаций пятичленных гетероциклов*.
Нельзя также забывать и о том, что в растворах и в жидкостях равновесие бывает смещено в сторону более полярных изомеров, а ими могут оказаться аксиальные конформеры. Так, исследова ния транс-2,3- и транс-2,5-дихлор-1,4-диоксанов XXVI и X X V I I , проведенные несколькими физическими методами [112—114], по казали, что в этих соединениях атомы хлора находятся в аксиаль
ных положениях. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
Кресло |
является «стандартной» конформацией шестичленных |
||||||||||||||||
колец. Однако в некоторых, правда весьма |
редких, |
случаях бо |
|||||||||||||||
|
|
|
лее стабильными оказываются конформа |
||||||||||||||
|
|
|
ции |
твист и даже |
ванна. Так, твист- |
||||||||||||
|
|
|
форма |
обнаружена в |
3,3,6,6-тетраметил- |
||||||||||||
|
|
|
|
1,2,4,5-тетратиане |
[115] |
XXVIII', |
|
форма |
|||||||||
|
|
|
|
ванны, по-видимому, встречается в некото |
|||||||||||||
|
|
|
|
рых углеводах [24, |
гл. 6], в особенности ес |
||||||||||||
|
|
|
| |
ли ей благоприятствуют водородные связи. |
|||||||||||||
|
|
|
Относительная |
затрудненность |
|
интер |
|||||||||||
|
|
|
|
конверсии |
шестичленных |
колец |
опреде |
||||||||||
|
|
|
|
ляется |
в |
основном жесткостью |
валент |
||||||||||
|
|
|
|
ных |
углов, |
поскольку |
в |
|
переходных |
||||||||
Рис. |
3.11. |
Структурная |
состояниях |
валентные |
углы |
сильно де |
|||||||||||
формируются. |
Барьеры |
интерконверсии |
|||||||||||||||
формула и |
геометриче |
||||||||||||||||
ские |
параметры, |
описы |
имеют |
одинаковый |
порядок |
величины |
|||||||||||
вающие |
конформацию |
независимо от того, какие |
гетероатомы |
||||||||||||||
глюкопиранозного |
коль |
находятся |
в |
кольце. |
|
Замечено, что при |
|||||||||||
ца. |
|
|
|
сутствие в кольце атома кислорода |
обыч- |
||||||||||||
но |
немного снижает |
||||||||||||||||
барьер |
[116], |
а |
наличие |
атомов |
азота |
||||||||||||
и серы несколько повышает его [117, |
118]. Так 1М,М'-диметилпи- |
перазин имеет свободную энергию активации инверсии кольца 12,6 ккал/моль при температуре коалесценции — 8,5 °С [118]; барьер инверсии в циклогексане, как мы указывали, близок к 11 ккал/моль (измерение свободной энергии переходного состоя ния [119] дало 10,3 ккал/моль). Для 1,3-диоксана измеренное
значение |
свободной энергии интерконверсии равно примерно |
|||||||
9,7 |
ккал/моль |
[120], |
для |
1,4-диоксана — соответственно |
||||
9.9 |
ккал/моль |
[121], |
для |
тетрагидропирана — также |
||||
9.9 ккал/моль |
[122]. |
|
конформации сахаров, |
а также |
||||
|
Рассмотрим |
|
теперь подробнее |
|||||
возможности различных конформационных превращений |
в |
них. |
||||||
|
Ривс |
[ 123] |
предложил |
несколько эмпирических правил, |
ха |
рактеризующих конформации пиранозных колец (шестичленных
колец, содержащих один гетероциклический атом |
кислорода). |
* Отмеченная закономерность является общей. Она имеет ту |
же природу, |
что и гош-эффект в более простых молекулах, а также аномерный |
эффект в са |
харах [270, 271]. |
|
170
Возможные конформации пиранозного кольца и их номенклатура, по Ривсу, приведены ниже:
Наиболее выгодными являются конформации кресла С1 и С2. Замечено, что наличие аксиальных гидроксильных групп в кольце, вообще говоря, уменьшает стабильность цикла. Правда, если имеется возможность для возникновения внутри- и межмо лекулярных водородных связей, то аксиальные заместители иногда даже стабилизируют цикл. Еще одной причиной дестаби лизации цикла является наличие аксиальной группы СН2ОН на той стороне кольца, где находятся другие объемистые заместители.
Рентгеноструктурные данные по конформациям сахаров де тально рассмотрены в обзорах [124, 1251. Правила Ривса подтвер ждаются почти для всех известных структур: шестичленные са хара в кристаллах существуют в конформациях кресла, обеспе чивающих минимальное число заместителей в аксиальных поло жениях. Длины связей С—С равны в среднем 1,53 А, С—О — 1,42 А; валентные углы ССС внутри цикла близки к тетраэдриче ским, а углы СОС обычно немного больше: 109—113°.
Не останавливаясь на деталях, связанных со строением и геометрией различных типов пиранозных колец (их возможное число очень велико), перейдем к проблемам, связанным с конформациями одного из них — глюкопиранозного кольца. На рис. 3.11 приведена его структурная формула и параметры, описывающие конформацию. Изомерные а- и p-D-глюкозы отли чаются одна от другой лишь относительным положением груп пы ОН при Сх: в а-изомере эта группа находится в аксиальном положении, в р-изомере— в экваториальном. Выбор именно этой молекулы определяется, во-первых, тем, что из всех пиранозных колец она представляет наибольший интерес для биохимии; во-вторых, тем, что ее конформации исследованы как экспери ментально, так и теоретически; в-третьих, основные особенности, обнаруженные для этой молекулы, можно легко распространить на другие пиранозные кольца.
В табл. 3.1 приведены положения заместителей — групп ОН и СН2ОН в различных конформациях глюкопиранозного кольца.
171
Исходя только из представления о невыгодности аксиальных за местителей, можно заключить [126], что самыми выгодными яв ляются конформации С1, В 1 и 3В. Однако кроме этого фактора важно учесть и то обстоятельство, что формы ванны вообще не выгодны: во-первых, они соответствуют большим энергиям на пряжения из-за отталкивания валентно не связанных атомов и значительного торсионного вклада; во-вторых, они соответствуют максимумам энергии на пути псевдовращения, минимумы же возникают при прохождении через теист-формы. Таким обра зом, сразу ясно, что форма С1 должна быть самой стабильной, поскольку в ней заместители находятся в благоприятных положе ниях; другому минимуму энергии должна отвечать форма 1C.
Т а б л и ц а 3.1. |
Положения заместителей в различных |
|
|
||
конформациях глюкопиранозного кольца |
|
|
|
||
|
|
Положение ОН-группы |
|
Положение |
|
Конформация |
|
|
|
|
|
при Ci |
при С2 |
при С3 |
при С4 |
группы |
|
|
сн2он |
||||
С1 |
а |
е |
е |
е |
е |
1C |
е |
а |
а |
а |
а |
В1 |
е |
а |
е |
е |
е |
1в |
а |
е |
а |
а |
а |
В2 |
а |
е |
е |
а |
а |
В |
а |
а |
а |
е |
е |
2 |
|
|
а |
|
|
ВЗ |
а |
а |
а |
е |
|
3В |
е |
е |
е |
е |
а |
Рамачандран и сотр. [127] рассчитали энергии различных кон формаций глюкопиранозного кольца с атом-атом потенциалами Китайгородского [128] и Флори [129] без учета торсионных на пряжений. При этом валентные и двугранные углы в кольце фиксировались (все углы ССС были приняты равными 109,5°, а угол СОС— 114°, откуда с учетом длин связей легко можно найти в двугранные углы), варьировались лишь %—углы поворота групп СН2ОН. Оба набора атом-атом потенциалов дали наимень шую энергию для конформации С1 с х ~ 175° (согласно экспери ментальным данным [130], этот угол равен 180 ± 12°). На вто ром месте по стабильности оказалась конформация 3В; другое кресло 1C явно невыгодно энергетически по сравнению с С1.
Более строгий анализ конформаций a-D-глюкозы проведен в нашей работе [131]. Кроме невалентных взаимодействий учиты
вались торсионные потенциалы с |
константами U0, равными |
3,0 ккал/моль для связей С—С и 1,0 |
ккал/моль для связей С—О. |
Валентные углы при минимизации потенциальной функции и поиске переходных состояний варьировались (упругая постоян ная для угла ССС равна 30 и для угла СОС соответственно
172
65 ккал-моль"1-рад-2). Учтены были также электростатические взаимодействия в монопольном приближении (заряды на атомах взяты из работы [132]), причем специально исследовано влияние неопределенности в величинах точечных зарядов на резуль таты расчетов.
Если считать валентные связи жесткими, то конформации шестичленного кольца описываются шестью независимыми пара метрами, в качестве которых можно принять валентные углы а 4,
а 5 и а 6 |
и двугранные углы <р4, ср5 и ф„ (см. рис. 3.11); |
остальные |
|||||||||
валентные |
и двугранные |
углы |
являют |
|
|
||||||
ся зависимыми |
и могут |
быть |
рассчита |
|
|
||||||
ны по формулам |
|
работы |
[133]. |
Заметим, |
|
|
|||||
что при |
конформационных переходах в |
|
|
||||||||
a-D-глюкозе торсионные углы |
меняют |
|
|
||||||||
ся в значительно больших пределах, чем |
|
|
|||||||||
валентные. |
Поэтому |
с |
некоторой точ |
|
|
||||||
ностью можно рассматривать гиперпо |
|
|
|||||||||
верхности, |
удовлетворяющие условию |
|
|
||||||||
U К , |
а6, а„, Ф4, |
Ф6, Фв) = const |
|
|
|||||||
как трехмерные |
U(ср4, |
ср5, |
срв). |
|
Рис. 3.12. Разрешенные |
||||||
Прежде всего, чтобы найти |
области |
||||||||||
области в |
пространстве |
||||||||||
локальных минимумов, |
имеет смысл про |
внутренних |
параметров |
||||||||
вести локальные спуски |
из случайно выб |
а-£>-глюкозы. |
|||||||||
ранных |
точек. На рис. 3.12 схематически |
|
|
||||||||
показаны разрешенные |
области |
в пространстве параметров ср4, |
|||||||||
ср5, ф6, ниже указано |
число попаданий в эти области из общего |
||||||||||
числа испытаний (из 127). |
|
|
|
|
|||||||
|
|
Область |
Число попада |
Область |
Число попада |
|
|||||
|
|
|
|
ний |
|
ник |
|
||||
|
|
А |
|
|
|
39 |
|
ГА' |
21 |
|
|
|
|
в |
|
|
|
13 |
|
В' |
0 |
|
|
|
|
с |
|
|
|
15 |
|
С' |
22 |
|
|
|
|
D |
|
|
|
1 |
|
D’ |
16 |
|
Локальные спуски завершаются близко к вершинам паралле лепипеда (см. рис. 3.12), причем в вершину В' не привел ни один спуск, а наибольшее число точек оказалось около вершины, соот ветствующей конформации кресла С1.
Уточнение в областях, близких к локальным минимумам, по казало, что оптимальной конформацией действительно является кресло С1, откуда следует, что к глобальному минимуму ведет наибольшее число путей из случайных точек. На втором месте по стабильности оказалась другая конформация кресла — 1C; далее следуют твист-формы, которые можно условно обозначить В 1 — 2В и В2 — 1В (понятно, что конформации ванна не соот ветствуют минимумам потенциальной поверхности). В табл. 3.2
173
Т а б л и ц а |
3.2. |
Расчетные геометрические параметры, |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
характеризующие конформации cc-Z?-глюкозы |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
Валентные углы. град. |
|
|
|
Двугранные углы, град. |
|
|
|||||
Равновесная |
конфор |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
^напр* |
|
мация |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ккал/моль |
|
|
<4 |
а 2 |
аз |
“4 |
«5 |
аб |
Ф1 |
Ф2 |
Фз |
Ф4 |
Ф5 |
Фб |
|
С 1 (опыт (134J) |
110, 1 |
1 1 1 , 1 |
109,8 |
1 1 1 , 2 |
108,7 |
113,8 |
54,1 |
—51,3 |
53,3 |
—57,5 |
62,2 |
—60,9 |
— |
|
С1 |
|
1 10, 6 |
110,7 |
109,7 |
110,4 |
111,5 |
113,2 |
56,2 |
—52,8 |
52,0 |
—55,2 |
59,8 |
—60,0 |
0, 0 |
1C |
|
111,7 |
109,2 |
1 1 1 , 8 |
1 1 2 , 6 |
113,4 |
114,4 |
—57,6 |
51,3 |
—46,2 |
46,0 |
—53,2 |
59,7 |
1,7 |
В1—2В твист |
112,3 |
109,6 |
1 1 1 , 6 |
110,9 |
113,6 |
114,9 |
—64,1 |
28,3 |
27,6 |
—59,1 |
25,6 |
35,0 |
4,0 |
|
В2— 1В твист |
113,8 |
111,5 |
1 1 1 , 8 |
112,9 |
114,6 |
116,4 |
58,5 |
—33,7 |
—17,8 |
53,8 |
—31,2 |
—24,0 |
7,4 |