Файл: Дашевский, В. Г. Конформации органических молекул.pdf

ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 15.10.2024

Просмотров: 163

Скачиваний: 0

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

атом*кольца. Впрочем, с подобной ситуацией мы уже встречались при обсуждении конформаций пятичленных гетероциклов*.

Нельзя также забывать и о том, что в растворах и в жидкостях равновесие бывает смещено в сторону более полярных изомеров, а ими могут оказаться аксиальные конформеры. Так, исследова­ ния транс-2,3- и транс-2,5-дихлор-1,4-диоксанов XXVI и X X V I I , проведенные несколькими физическими методами [112—114], по­ казали, что в этих соединениях атомы хлора находятся в аксиаль­

ных положениях.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Кресло

является «стандартной» конформацией шестичленных

колец. Однако в некоторых, правда весьма

редких,

случаях бо­

 

 

 

лее стабильными оказываются конформа­

 

 

 

ции

твист и даже

ванна. Так, твист-

 

 

 

форма

обнаружена в

3,3,6,6-тетраметил-

 

 

 

 

1,2,4,5-тетратиане

[115]

XXVIII',

 

форма

 

 

 

 

ванны, по-видимому, встречается в некото­

 

 

 

 

рых углеводах [24,

гл. 6], в особенности ес­

 

 

 

|

ли ей благоприятствуют водородные связи.

 

 

 

Относительная

затрудненность

 

интер­

 

 

 

 

конверсии

шестичленных

колец

опреде­

 

 

 

 

ляется

в

основном жесткостью

валент­

 

 

 

 

ных

углов,

поскольку

в

 

переходных

Рис.

3.11.

Структурная

состояниях

валентные

углы

сильно де­

формируются.

Барьеры

интерконверсии

формула и

геометриче­

ские

параметры,

описы­

имеют

одинаковый

порядок

величины

вающие

конформацию

независимо от того, какие

гетероатомы

глюкопиранозного

коль­

находятся

в

кольце.

 

Замечено, что при­

ца.

 

 

 

сутствие в кольце атома кислорода

обыч-

но

немного снижает

барьер

[116],

а

наличие

атомов

азота

и серы несколько повышает его [117,

118]. Так 1М,М'-диметилпи-

перазин имеет свободную энергию активации инверсии кольца 12,6 ккал/моль при температуре коалесценции — 8,5 °С [118]; барьер инверсии в циклогексане, как мы указывали, близок к 11 ккал/моль (измерение свободной энергии переходного состоя­ ния [119] дало 10,3 ккал/моль). Для 1,3-диоксана измеренное

значение

свободной энергии интерконверсии равно примерно

9,7

ккал/моль

[120],

для

1,4-диоксана — соответственно

9.9

ккал/моль

[121],

для

тетрагидропирана — также

9.9 ккал/моль

[122].

 

конформации сахаров,

а также

 

Рассмотрим

 

теперь подробнее

возможности различных конформационных превращений

в

них.

 

Ривс

[ 123]

предложил

несколько эмпирических правил,

ха­

рактеризующих конформации пиранозных колец (шестичленных

колец, содержащих один гетероциклический атом

кислорода).

* Отмеченная закономерность является общей. Она имеет ту

же природу,

что и гош-эффект в более простых молекулах, а также аномерный

эффект в са­

харах [270, 271].

 

170



Возможные конформации пиранозного кольца и их номенклатура, по Ривсу, приведены ниже:

Наиболее выгодными являются конформации кресла С1 и С2. Замечено, что наличие аксиальных гидроксильных групп в кольце, вообще говоря, уменьшает стабильность цикла. Правда, если имеется возможность для возникновения внутри- и межмо­ лекулярных водородных связей, то аксиальные заместители иногда даже стабилизируют цикл. Еще одной причиной дестаби­ лизации цикла является наличие аксиальной группы СН2ОН на той стороне кольца, где находятся другие объемистые заместители.

Рентгеноструктурные данные по конформациям сахаров де­ тально рассмотрены в обзорах [124, 1251. Правила Ривса подтвер­ ждаются почти для всех известных структур: шестичленные са­ хара в кристаллах существуют в конформациях кресла, обеспе­ чивающих минимальное число заместителей в аксиальных поло­ жениях. Длины связей С—С равны в среднем 1,53 А, С—О — 1,42 А; валентные углы ССС внутри цикла близки к тетраэдриче­ ским, а углы СОС обычно немного больше: 109—113°.

Не останавливаясь на деталях, связанных со строением и геометрией различных типов пиранозных колец (их возможное число очень велико), перейдем к проблемам, связанным с конформациями одного из них — глюкопиранозного кольца. На рис. 3.11 приведена его структурная формула и параметры, описывающие конформацию. Изомерные а- и p-D-глюкозы отли­ чаются одна от другой лишь относительным положением груп­ пы ОН при Сх: в а-изомере эта группа находится в аксиальном положении, в р-изомере— в экваториальном. Выбор именно этой молекулы определяется, во-первых, тем, что из всех пиранозных колец она представляет наибольший интерес для биохимии; во-вторых, тем, что ее конформации исследованы как экспери­ ментально, так и теоретически; в-третьих, основные особенности, обнаруженные для этой молекулы, можно легко распространить на другие пиранозные кольца.

В табл. 3.1 приведены положения заместителей — групп ОН и СН2ОН в различных конформациях глюкопиранозного кольца.

171

Исходя только из представления о невыгодности аксиальных за­ местителей, можно заключить [126], что самыми выгодными яв­ ляются конформации С1, В 1 и 3В. Однако кроме этого фактора важно учесть и то обстоятельство, что формы ванны вообще не­ выгодны: во-первых, они соответствуют большим энергиям на­ пряжения из-за отталкивания валентно не связанных атомов и значительного торсионного вклада; во-вторых, они соответствуют максимумам энергии на пути псевдовращения, минимумы же возникают при прохождении через теист-формы. Таким обра­ зом, сразу ясно, что форма С1 должна быть самой стабильной, поскольку в ней заместители находятся в благоприятных положе­ ниях; другому минимуму энергии должна отвечать форма 1C.

Т а б л и ц а 3.1.

Положения заместителей в различных

 

 

конформациях глюкопиранозного кольца

 

 

 

 

 

Положение ОН-группы

 

Положение

Конформация

 

 

 

 

при Ci

при С2

при С3

при С4

группы

 

сн2он

С1

а

е

е

е

е

1C

е

а

а

а

а

В1

е

а

е

е

е

1в

а

е

а

а

а

В2

а

е

е

а

а

В

а

а

а

е

е

2

 

 

а

 

 

ВЗ

а

а

а

е

3В

е

е

е

е

а

Рамачандран и сотр. [127] рассчитали энергии различных кон­ формаций глюкопиранозного кольца с атом-атом потенциалами Китайгородского [128] и Флори [129] без учета торсионных на­ пряжений. При этом валентные и двугранные углы в кольце фиксировались (все углы ССС были приняты равными 109,5°, а угол СОС— 114°, откуда с учетом длин связей легко можно найти в двугранные углы), варьировались лишь %—углы поворота групп СН2ОН. Оба набора атом-атом потенциалов дали наимень­ шую энергию для конформации С1 с х ~ 175° (согласно экспери­ ментальным данным [130], этот угол равен 180 ± 12°). На вто­ ром месте по стабильности оказалась конформация 3В; другое кресло 1C явно невыгодно энергетически по сравнению с С1.

Более строгий анализ конформаций a-D-глюкозы проведен в нашей работе [131]. Кроме невалентных взаимодействий учиты­

вались торсионные потенциалы с

константами U0, равными

3,0 ккал/моль для связей С—С и 1,0

ккал/моль для связей С—О.

Валентные углы при минимизации потенциальной функции и поиске переходных состояний варьировались (упругая постоян­ ная для угла ССС равна 30 и для угла СОС соответственно

172


65 ккал-моль"1-рад-2). Учтены были также электростатические взаимодействия в монопольном приближении (заряды на атомах взяты из работы [132]), причем специально исследовано влияние неопределенности в величинах точечных зарядов на резуль­ таты расчетов.

Если считать валентные связи жесткими, то конформации шестичленного кольца описываются шестью независимыми пара­ метрами, в качестве которых можно принять валентные углы а 4,

а 5 и а 6

и двугранные углы <р4, ср5 и ф„ (см. рис. 3.11);

остальные

валентные

и двугранные

углы

являют­

 

 

ся зависимыми

и могут

быть

рассчита­

 

 

ны по формулам

 

работы

[133].

Заметим,

 

 

что при

конформационных переходах в

 

 

a-D-глюкозе торсионные углы

меняют­

 

 

ся в значительно больших пределах, чем

 

 

валентные.

Поэтому

с

некоторой точ­

 

 

ностью можно рассматривать гиперпо­

 

 

верхности,

удовлетворяющие условию

 

 

U К ,

а6, а„, Ф4,

Ф6, Фв) = const

 

 

как трехмерные

U(ср4,

ср5,

срв).

 

Рис. 3.12. Разрешенные

Прежде всего, чтобы найти

области

области в

пространстве

локальных минимумов,

имеет смысл про­

внутренних

параметров

вести локальные спуски

из случайно выб­

а-£>-глюкозы.

ранных

точек. На рис. 3.12 схематически

 

 

показаны разрешенные

области

в пространстве параметров ср4,

ср5, ф6, ниже указано

число попаданий в эти области из общего

числа испытаний (из 127).

 

 

 

 

 

 

Область

Число попада­

Область

Число попада

 

 

 

 

 

ний

 

ник

 

 

 

А

 

 

 

39

 

ГА'

21

 

 

 

в

 

 

 

13

 

В'

0

 

 

 

с

 

 

 

15

 

С'

22

 

 

 

D

 

 

 

1

 

D’

16

 

Локальные спуски завершаются близко к вершинам паралле­ лепипеда (см. рис. 3.12), причем в вершину В' не привел ни один спуск, а наибольшее число точек оказалось около вершины, соот­ ветствующей конформации кресла С1.

Уточнение в областях, близких к локальным минимумам, по­ казало, что оптимальной конформацией действительно является кресло С1, откуда следует, что к глобальному минимуму ведет наибольшее число путей из случайных точек. На втором месте по стабильности оказалась другая конформация кресла — 1C; далее следуют твист-формы, которые можно условно обозначить В 1 — и В2 — 1В (понятно, что конформации ванна не соот­ ветствуют минимумам потенциальной поверхности). В табл. 3.2

173


Т а б л и ц а

3.2.

Расчетные геометрические параметры,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

характеризующие конформации cc-Z?-глюкозы

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Валентные углы. град.

 

 

 

Двугранные углы, град.

 

 

Равновесная

конфор­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

^напр*

мация

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ккал/моль

 

 

<4

а 2

аз

“4

«5

аб

Ф1

Ф2

Фз

Ф4

Ф5

Фб

 

С 1 (опыт (134J)

110, 1

1 1 1 , 1

109,8

1 1 1 , 2

108,7

113,8

54,1

—51,3

53,3

—57,5

62,2

—60,9

С1

 

1 10, 6

110,7

109,7

110,4

111,5

113,2

56,2

—52,8

52,0

—55,2

59,8

—60,0

0, 0

1C

 

111,7

109,2

1 1 1 , 8

1 1 2 , 6

113,4

114,4

—57,6

51,3

—46,2

46,0

—53,2

59,7

1,7

В1—2В твист

112,3

109,6

1 1 1 , 6

110,9

113,6

114,9

—64,1

28,3

27,6

—59,1

25,6

35,0

4,0

В21В твист

113,8

111,5

1 1 1 , 8

112,9

114,6

116,4

58,5

—33,7

—17,8

53,8

—31,2

—24,0

7,4