Файл: Краббе П. Применение хироптических методов в химии.pdf

ВУЗ: Не указан

Категория: Не указан

Дисциплина: Не указана

Добавлен: 13.07.2024

Просмотров: 125

Скачиваний: 0

ВНИМАНИЕ! Если данный файл нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам.

88 Глава 4

и вторичных структур нуклеиновых кислот предста­ вляется исключительно важным, так как они играют главную роль в наследственности.

Нуклеиновые кислоты имеют сходство с белками; они, как и белки, представляют собой длинную цепь, к кото­

рой присоединены различные

группы. К а ж д а я

индиви­

дуальная нуклеиновая кислота

характеризуется

приро­

дой и последовательностью присоединения этих групп. Если в белковой молекуле основной цепью является

полиамидная цепь, то главной цепью молекулы нуклеи­ новой кислоты является полиэфирная цепь, называемая полинуклеотидной. Эфир образуется из фосфорной кис­ лоты и звена углевода. Одно из многочисленных гетеро­ циклических оснований присоединено к атому С-1 каж ­ дого звена углевода через р-связь. Звено основание — углевод называется нуклеозидом. Нуклеотидом на­

зывается звено основание — углевод — фосфорная

кис­

лота.

 

 

 

 

 

 

В группе нуклеиновых кислот, известных как рибо­

нуклеиновые кислоты

( Р Н К ) , углеводом

является

D - ри -

боза, дезоксирибонуклеиновые

кислоты

( Д Н К )

построе­

ны из

D-2-дезоксирибозы. Основаниями

в Д Н К

являются

аденин и гуанин, которые содержат пуриновую

цикличе­

скую систему, и цитознн, тимин

и 5-метилцитозин,

содер­

ж а щ и е

пиримидиновое

кольцо.

Р Н К содержит

аденин,

гуанин, цитозин и урацил. Свойства этих оснований и их последовательность в полинуклеотидной цепи различны для разных нуклеиновых кислот. Это их первичная струк­ тура, а спиральная или неупорядоченная конформация образуют вторичную структуру (разд. 5.1). Пиримидинрибозид 51 и пурин-2-дезоксирибозид 52 являются пред­ ставителями этого важного класса природных соедине­ ний.

о

51

5 ?


 

Амиды, пептиды, нуклеозиды и

др.

89

Гетероциклические системы, которые входят в состав

нуклеозидов,

являются

ахиральиыми;

они становятся

оптически активными только в днссимметрическом

окру­

жении. Было

показано,

что электронные

спектры

погло­

щения пиримидинов и пуринов можно сравнить со спек­ тром поглощения бензола. Кроме того, довольно сильные

эффекты Коттона наблюдаются между 200 и 300 нм

[18,

291, 298, 433, 561—563].

Теоретические исследования этих хромофоров пока­ зали, что спектры поглощения рибонуклеотидов в обла­ сти 190—300 им имеют л - »л* - природу [298, 564, 565]. Ме­ тод вычисления вращательной силы с помощью теории связанного осциллятора, особенно в случае циклонуклеозидов, указывает на то, что эта теория объясняет боль­ шинство примеров проявления оптической активности в

пиримидиновых нуклеозидах

[83]. Метод

КД, как

один

из многих экспериментальных

методов

изучения

глико-

зидной конформации в нуклеозидах, использован недавно для исследования конформации цитидина, 2',3'-изопро- пилиденцмтидина, уридина и 2/ ,3'-изопропилиденуридина в воде и органических растворителях [566]. Данные, по­ лученные с помощью КД, для многочисленных пирими­ диновых нуклеозидов позволяют, кроме того, изучить фуранозную конформацию, влияющую на оптическую активность [564, 565].

Хироптическим свойствам этих биологически важных веществ посвящен т а к ж е ряд других сообщений [433, 563, 567—575] (см. также разд. 5.1).

4.3.ПИГМЕНТЫ, ПОРФИРИНЫ

ИРОДСТВЕННЫЕ СОЕДИНЕНИЯ

Опубликованы работы, посвященные исследованию оптических свойств ряда оксиантрахиноновых пигментов,

экстрагированных из различных

культур

streptomyces

[18]. Относительная

конфигурация

и конформация

агли-

конов антибиотиков,

родомицинонов, изородомицинонов

и пирромицинонов

определены

на

основании

близости

интенсивностей их

кривых К Д

между 260

и

380

нм

[18, 317—320]. Кроме того, появился ряд сообщений, посвященных установлению конфигурации главных



90 Глава 4

представителей тетрациклиновой группы антибиотиков [317—320].

Порфирины образуют важный класс природных со­ единений, в который входят хлорофилл, витамин В12 и родственные соединения. Тетрапиррольные ядра, находя­ щиеся в большинстве этих соединений, обусловливают

сложные УФ-спектры с

многочисленными электронными

переходами. Измерены

Д О В и К Д различных биологи­

чески активных металлопорфиринов [576, 577] и хлоро­ филла [578]. Подробное изучение хлоринов, являющихся оптически активными 7,8-дигидропорфиринами, позволи­ ло установить эмпирическую корреляцию между строе­ нием молекул и их хироптическими свойствами [579]. Де ­

тальное исследование КД-свойств производных

кобала-

мина,

и

особенно цианокобаламина

(витамина

B i 2 ) ,

по­

могло

идентифицировать

различные

переходы,

принад­

л е ж а щ и е

этим

металлоорганическим

системам

[18,

580,

581].

 

 

 

 

 

 

 

Появились

различные

сообщения, посвященные иссле­

дованию

хироптических

свойств пигментов желчи,

та­

ких, как стеркобилин [582] и уробилин [583—586]. Иссле­ дование температурной зависимости К Д /-стеркобилина и d-уробилина показало, что конформация этих соедине­ ний изменяется с температурой. Конформациониые изме­ нения зависят от способности растворителя образовывать водородные связи. Спиральная конформация дипиррилметенового хромофора обращается при низких темпера­ турах в метанол-глицериновых растворах, тогда как в растворе хлороформа обращения не происходит [583— 586].

Другие важные особенности таких хромофоров — пе­ ренос заряда и спиральная конформация больших био­ молекул (полипептидов, полииуклеотидов, нуклеиновых кислот и т. д.) — рассмотрены в следующих главах.


Г Л А В А 5

Оптически активные полимеры

В начале этого столетия было обнаружено, что не­ которые природные вещества, как показано позднее, являющиеся высокополимерами, обладают оптической активностью. Однако отсутствие в то время удовлетвори­ тельных методов очистки сделало невозможным дальней­ шее изучение их оптических свойств. Поляриметрия при­ менялась тогда почти исключительно для структурного и стереохимического изучения небольших молекул.

В течение последних двадцати лет наблюдался про­ гресс не только в области техники измерения Д О В и К Д , но и в области очистки биополимеров. В связи с этим на исследование хироптических свойств природных полиме­ ров было обращено большое внимание. В настоящее время получено значительное число оптически активных синтетических высокополимеров и исследованы их опти­ ческие свойства.

5.1. ПРИРОДНЫЕ ПОЛИМЕРЫ

Спектроскопические методы, и особенно методы Д О В и К Д , несомненно играют в а ж н у ю роль в изучении био­ полимеров. Поскольку в настоящее время имеются моно­ графии и обзорные статьи по конформации белков, по нуклеопротеинам, рибосомам, вирусам, липопротеинам, мембранам и другим макромолекулам [17—21, 433, 563, 587, 594], в этой книге будут упомянуты только наиболее важные положения и некоторые результаты, полученные недавно.

Все природные биополимеры, образованные из угле­ водных или аминокислотных единиц, например полиса­ хариды, белки, полипептиды, полинуклеотиды и фермен­ ты (включая целлюлозу, декстран, желатину и т. д . ),

92 Глава 5

являются оптически активными [17—21]. Хироптические свойства зависят как от их первичной структуры (напри­ мер, от особенностей химического строения), так и от их вторичной структуры (например, спиральной пли неупо­ рядоченной конформации) . Методы Д О В и К Д занимают прочное место в химии белков, хотя информация о строе­ нии, которую они дают, сравнительно невелика. Таким образом, методы Д О В и К Д являются общепринятыми методами при изучении биомолекул, при контроле за их

чистотой и условиями

их хранения, при изучении реак­

ций восстановления,

денатурации, разложения и т. д.

Кроме того, хироптические методы используются с целью изучения влияния природы растворителя, степени соль­ ватации, изменения рН среды, температуры и т. д.

Открытие аномальной дисперсии а-спиральных поли­ пептидов показало существование конформацнонного вращения, обусловленного спиральной структурой [44, 45, 49—55, 587]. Известно, что нативные белки обладают го­ раздо меньшим отрицательным вращением, чем денату­ рированные белки. Это позволило предположить, что такие изменения во вращении связаны с потерей спираль­ ное™. Уравнение, в ы р а ж а ю щ е е свойства Д О В а-спи­ ральных полипептидов, было использовано в качестве основы для оценки содержания а-спиралей во многих ти­ пах синтетических полипептидов и белков. Рассмотре­ ние этой проблемы с теоретической точки зрения допу­ скает связывание экситонов и показывает, что сильные эффекты Коттона противоположных знаков (куплет) д о л ж н ы возникать в результате каждого сильного элек­ тронного перехода, такого, как я°—>я-переход при 190 нм. Подобные электронные переходы имеют парал ­ лельную и перпендикулярную поляризации относительно оси а-спирали [44, 45, 588, 589]. Позднее показано, что для неопределенно длинной спирали они вызывают появ­ ление другого куплета. Такой более точный подход с точ­ ки зрения экситонной теории позволяет предсказать че­ тыре полосы для каждого сильного поглощения. Д л я осспирали их появление ожидается при 185, 189 и 193 нм. Кроме того, как показано в разд. 4.1, для /г—^"'-пере­ хода пептидной связи оптическая активность ожидается около 216 нм [69, 70, 554—557]. Современные приборы не