ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 13.07.2024
Просмотров: 125
Скачиваний: 0
88 Глава 4
и вторичных структур нуклеиновых кислот предста вляется исключительно важным, так как они играют главную роль в наследственности.
Нуклеиновые кислоты имеют сходство с белками; они, как и белки, представляют собой длинную цепь, к кото
рой присоединены различные |
группы. К а ж д а я |
индиви |
дуальная нуклеиновая кислота |
характеризуется |
приро |
дой и последовательностью присоединения этих групп. Если в белковой молекуле основной цепью является
полиамидная цепь, то главной цепью молекулы нуклеи новой кислоты является полиэфирная цепь, называемая полинуклеотидной. Эфир образуется из фосфорной кис лоты и звена углевода. Одно из многочисленных гетеро циклических оснований присоединено к атому С-1 каж дого звена углевода через р-связь. Звено основание — углевод называется нуклеозидом. Нуклеотидом на
зывается звено основание — углевод — фосфорная |
кис |
|||||
лота. |
|
|
|
|
|
|
В группе нуклеиновых кислот, известных как рибо |
||||||
нуклеиновые кислоты |
( Р Н К ) , углеводом |
является |
D - ри - |
|||
боза, дезоксирибонуклеиновые |
кислоты |
( Д Н К ) |
построе |
|||
ны из |
D-2-дезоксирибозы. Основаниями |
в Д Н К |
являются |
|||
аденин и гуанин, которые содержат пуриновую |
цикличе |
|||||
скую систему, и цитознн, тимин |
и 5-метилцитозин, |
содер |
||||
ж а щ и е |
пиримидиновое |
кольцо. |
Р Н К содержит |
аденин, |
гуанин, цитозин и урацил. Свойства этих оснований и их последовательность в полинуклеотидной цепи различны для разных нуклеиновых кислот. Это их первичная струк тура, а спиральная или неупорядоченная конформация образуют вторичную структуру (разд. 5.1). Пиримидинрибозид 51 и пурин-2-дезоксирибозид 52 являются пред ставителями этого важного класса природных соедине ний.
о
51 |
5 ? |
|
Амиды, пептиды, нуклеозиды и |
др. |
89 |
|
Гетероциклические системы, которые входят в состав |
||||
нуклеозидов, |
являются |
ахиральиыми; |
они становятся |
|
оптически активными только в днссимметрическом |
окру |
|||
жении. Было |
показано, |
что электронные |
спектры |
погло |
щения пиримидинов и пуринов можно сравнить со спек тром поглощения бензола. Кроме того, довольно сильные
эффекты Коттона наблюдаются между 200 и 300 нм |
|
[18, |
291, 298, 433, 561—563]. |
Теоретические исследования этих хромофоров пока зали, что спектры поглощения рибонуклеотидов в обла сти 190—300 им имеют л - »л* - природу [298, 564, 565]. Ме тод вычисления вращательной силы с помощью теории связанного осциллятора, особенно в случае циклонуклеозидов, указывает на то, что эта теория объясняет боль шинство примеров проявления оптической активности в
пиримидиновых нуклеозидах |
[83]. Метод |
КД, как |
один |
из многих экспериментальных |
методов |
изучения |
глико- |
зидной конформации в нуклеозидах, использован недавно для исследования конформации цитидина, 2',3'-изопро- пилиденцмтидина, уридина и 2/ ,3'-изопропилиденуридина в воде и органических растворителях [566]. Данные, по лученные с помощью КД, для многочисленных пирими диновых нуклеозидов позволяют, кроме того, изучить фуранозную конформацию, влияющую на оптическую активность [564, 565].
Хироптическим свойствам этих биологически важных веществ посвящен т а к ж е ряд других сообщений [433, 563, 567—575] (см. также разд. 5.1).
4.3.ПИГМЕНТЫ, ПОРФИРИНЫ
ИРОДСТВЕННЫЕ СОЕДИНЕНИЯ
Опубликованы работы, посвященные исследованию оптических свойств ряда оксиантрахиноновых пигментов,
экстрагированных из различных |
культур |
streptomyces |
||||
[18]. Относительная |
конфигурация |
и конформация |
агли- |
|||
конов антибиотиков, |
родомицинонов, изородомицинонов |
|||||
и пирромицинонов |
определены |
на |
основании |
близости |
||
интенсивностей их |
кривых К Д |
между 260 |
и |
380 |
нм |
[18, 317—320]. Кроме того, появился ряд сообщений, посвященных установлению конфигурации главных
90 Глава 4
представителей тетрациклиновой группы антибиотиков [317—320].
Порфирины образуют важный класс природных со единений, в который входят хлорофилл, витамин В12 и родственные соединения. Тетрапиррольные ядра, находя щиеся в большинстве этих соединений, обусловливают
сложные УФ-спектры с |
многочисленными электронными |
переходами. Измерены |
Д О В и К Д различных биологи |
чески активных металлопорфиринов [576, 577] и хлоро филла [578]. Подробное изучение хлоринов, являющихся оптически активными 7,8-дигидропорфиринами, позволи ло установить эмпирическую корреляцию между строе нием молекул и их хироптическими свойствами [579]. Де
тальное исследование КД-свойств производных |
кобала- |
||||||
мина, |
и |
особенно цианокобаламина |
(витамина |
B i 2 ) , |
по |
||
могло |
идентифицировать |
различные |
переходы, |
принад |
|||
л е ж а щ и е |
этим |
металлоорганическим |
системам |
[18, |
580, |
||
581]. |
|
|
|
|
|
|
|
Появились |
различные |
сообщения, посвященные иссле |
|||||
дованию |
хироптических |
свойств пигментов желчи, |
та |
ких, как стеркобилин [582] и уробилин [583—586]. Иссле дование температурной зависимости К Д /-стеркобилина и d-уробилина показало, что конформация этих соедине ний изменяется с температурой. Конформациониые изме нения зависят от способности растворителя образовывать водородные связи. Спиральная конформация дипиррилметенового хромофора обращается при низких темпера турах в метанол-глицериновых растворах, тогда как в растворе хлороформа обращения не происходит [583— 586].
Другие важные особенности таких хромофоров — пе ренос заряда и спиральная конформация больших био молекул (полипептидов, полииуклеотидов, нуклеиновых кислот и т. д.) — рассмотрены в следующих главах.
Г Л А В А 5
Оптически активные полимеры
В начале этого столетия было обнаружено, что не которые природные вещества, как показано позднее, являющиеся высокополимерами, обладают оптической активностью. Однако отсутствие в то время удовлетвори тельных методов очистки сделало невозможным дальней шее изучение их оптических свойств. Поляриметрия при менялась тогда почти исключительно для структурного и стереохимического изучения небольших молекул.
В течение последних двадцати лет наблюдался про гресс не только в области техники измерения Д О В и К Д , но и в области очистки биополимеров. В связи с этим на исследование хироптических свойств природных полиме ров было обращено большое внимание. В настоящее время получено значительное число оптически активных синтетических высокополимеров и исследованы их опти ческие свойства.
5.1. ПРИРОДНЫЕ ПОЛИМЕРЫ
Спектроскопические методы, и особенно методы Д О В и К Д , несомненно играют в а ж н у ю роль в изучении био полимеров. Поскольку в настоящее время имеются моно графии и обзорные статьи по конформации белков, по нуклеопротеинам, рибосомам, вирусам, липопротеинам, мембранам и другим макромолекулам [17—21, 433, 563, 587, 594], в этой книге будут упомянуты только наиболее важные положения и некоторые результаты, полученные недавно.
Все природные биополимеры, образованные из угле водных или аминокислотных единиц, например полиса хариды, белки, полипептиды, полинуклеотиды и фермен ты (включая целлюлозу, декстран, желатину и т. д . ),
92 Глава 5
являются оптически активными [17—21]. Хироптические свойства зависят как от их первичной структуры (напри мер, от особенностей химического строения), так и от их вторичной структуры (например, спиральной пли неупо рядоченной конформации) . Методы Д О В и К Д занимают прочное место в химии белков, хотя информация о строе нии, которую они дают, сравнительно невелика. Таким образом, методы Д О В и К Д являются общепринятыми методами при изучении биомолекул, при контроле за их
чистотой и условиями |
их хранения, при изучении реак |
ций восстановления, |
денатурации, разложения и т. д. |
Кроме того, хироптические методы используются с целью изучения влияния природы растворителя, степени соль ватации, изменения рН среды, температуры и т. д.
Открытие аномальной дисперсии а-спиральных поли пептидов показало существование конформацнонного вращения, обусловленного спиральной структурой [44, 45, 49—55, 587]. Известно, что нативные белки обладают го раздо меньшим отрицательным вращением, чем денату рированные белки. Это позволило предположить, что такие изменения во вращении связаны с потерей спираль ное™. Уравнение, в ы р а ж а ю щ е е свойства Д О В а-спи ральных полипептидов, было использовано в качестве основы для оценки содержания а-спиралей во многих ти пах синтетических полипептидов и белков. Рассмотре ние этой проблемы с теоретической точки зрения допу скает связывание экситонов и показывает, что сильные эффекты Коттона противоположных знаков (куплет) д о л ж н ы возникать в результате каждого сильного элек тронного перехода, такого, как я°—>я-переход при 190 нм. Подобные электронные переходы имеют парал лельную и перпендикулярную поляризации относительно оси а-спирали [44, 45, 588, 589]. Позднее показано, что для неопределенно длинной спирали они вызывают появ ление другого куплета. Такой более точный подход с точ ки зрения экситонной теории позволяет предсказать че тыре полосы для каждого сильного поглощения. Д л я осспирали их появление ожидается при 185, 189 и 193 нм. Кроме того, как показано в разд. 4.1, для /г—^"'-пере хода пептидной связи оптическая активность ожидается около 216 нм [69, 70, 554—557]. Современные приборы не