Файл: Новые методы анализа аминокислот, пептидов и белков..pdf
ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 14.10.2024
Просмотров: 147
Скачиваний: 0
ДОСТУПНОСТЬ ДЛЯ РЕАГЕНТОВ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ |
37] |
||
|
Cl—so2 |
СНз |
IV |
СН2—СН—СН2—О |
|
V |
|
\ |
о/ |
|
|
|
о |
|
|
VI
а второй несет реакционноспособную группировку Q—R. В ка честве таких реагентов для инактивации трипсина были исполь зованы метилгуанидин (О—А) и моноиодацетамид (Q—R). И действительно, порознь эти соединения не являются ингиби торами фермента; при совместном применении наблюдается инактивация трипсина. Инагами показал, что в качестве О—А- группы не может выступать бутилгуанидин, следовательно, для проявления ингибиторной активности существенное значение имеют размеры О-группировки
Н х |
I |
X - R - Q |
||
Р | + А-О + R-Q |
||||
Р I |
I |
|||
|
I |
У—А-О |
9.4.3.Введение негативной метки
Если остаток определенной аминокислоты маскирован или каким-либо иным образом защищен от действия реагента, можно пометить все остальные остатки этого типа, т. е. ввести «негативную» метку. Коэн и Варинга [226] обрабатывали холин эстеразу с помощью ДФФ в присутствии бутирилхолина, маски рующего активный центр. Затем модифицированный белок об рабатывали меченым ДФФ (32Р) в отсутствие бутирилхолина. Аналогичный метод был применен Кошландом с сотр. [227] при исследовании антител: вначале антитела к я-азобензоларсенату иодировали в присутствии гаптена, а затем в модифицирован ный белок вводили 13Ч.
Аминокислотные остатки активного центра фермента маски руют молекулами ингибитора или субстрата. Результаты моди фикации в присутствии и в отсутствие этих лигандов дают ин формацию относительно строения активного центра. При низкой концентрации перекись водорода в диоксане окисляет 5 из 7
ДОСТУПНОСТЬ ДЛЯ РЕАГЕНТОВ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ |
373 |
сти [233, 234]. В последнее время свойства этих соединений обра зовывать поперечные связи в молекуле фермента или между фер ментом и синтетическим полимером стали использоваться для стабилизации ферментов и белков или их фиксации на нераство римом носителе [235—237]. В области химии белка большой инте рес представляет возможность с помощью подобных реагентов определять расстояние между двумя аминогруппами в нативном белке. Одним из первых реагентов, нашедших подобное примене ние, является 2,4-динитро-1,5-дифторбензол (НФБ) [238, 239].
F
N 02
При обработке белка здесь образуется 2,4-динитрофенилено- вый мостик между двумя свободными аминогруппами. Образова ние такого мостика между а-аминогруппой Gly А1 и е-амино- группой Lys В29 в инсулине свидетельствует о большой гибкости этих полипептидных цепей в растворе. В случае лизоцима [240] мостик замыкается между Lys 7 и Lys 41, пространственно сбли женных в третичной структуре [241]. Фэсолд синтезировал 2,2'-ди- карбокси-4,4'-азофенилдиизоцианат, который использовал при исследовании миоглобина кашалота [242—245]. Здесь были иден тифицированы 4 внутримолекулярных мостика: Lys 16—Lys 34, Lys 34—Lys 47, Lys 56—Lys 62, Lys 145—Lys 147.
Аналогичный реагент, гексаметилендиизоцианат, модифици рует в рибонуклеазе 2 моля лизина [246]. С помощью другого реагента /гщ'-дифтор-ж.ж'-динитродифенилсульфона (ФНФС) [247] модифицировали 20 остатков лизина и некоторые остатки тиро зина в бычьем сывороточном альбумине [247—250]. Херциг с сотр. [251] синтезировал водорастворимые бифункциональные реагенты, фенол-2,4-дисульфохлорид и а-нафтол-2,4-дисульфо- хлорид, и использовал их для образования мостиков между остатками лизина в лизоциме. При исследовании лизоцима ис пользовали также а.а'-дибромксилолсульфокислоту (БКС) [252], несущую радиоактивные метки 35S и 3Н; таким путем в лизоциме было обнаружено образование двух мостиков, Lys3—Lys 116 и Lys 96—Lys 97, что совпадает с результатами, полученными при модификации Lys 13, Lys 33 и Lys 116 фенол-2,4-дисульфохлори- дом [251]. При такой модификации аминогруппы уже не несут в нейтральной среде положительного заряда, вследствие чего тре тичная структура становится менее стабильной, подверженной конформационным изменениям. Учитывая это обстоятельство, Зингер с сотр. [138, 253] синтезировал дихлоргидрат диэтилма-