Файл: Новые методы анализа аминокислот, пептидов и белков..pdf
ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 14.10.2024
Просмотров: 142
Скачиваний: 0
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ АМИНОКИСЛОТ |
95 |
В случае белков трудности, связанные с цистеиновой кисло той, можно обойти, превратив перед гидролизом белка цистеин в карбоксиметилцистеин. Этот метод в настоящее время широко используется при подготовке белков для аминокислотного ана лиза на смоле [24]. Карбоксиметилцистеин можно этерифицировать и ацилировать; по данным авторов этой главы, ди-н-пропи- ловый эфир N-ацетилкарбоксиметилцистеина легко и количе ственно хроматографируется на колонках с карбоваксом,причем соответствующий пик расположен между пиками глутаминовой кислоты и тирозина. В отношении хроматографии метионина, а также метионинсульфона и метионинсульфоксида [72, 78, 150] путаница существовала до тех пор, пока эти соединения не стали объектом специального исследования их N-ТФА-метило- вых эфиров [125]. В процессе получения производных метионинсульфоксид превращали в метиловый эфир N-ТФА-метионина, и поэтому он элюировался вместе с метионином. Превращение, однако, не было полным, так как только 52% сульфоксида появлялось на хроматограмме в виде нативной кислоты, а ос тальное количество разрушалось. Попытки получить пик сульфона [125] оказались неудачными — вероятно, это соединение разрушалось. В лаборатории авторов этой главы был получен пик н-пропилового эфира сульфона N-ацетилметионина, однако количественная оценка этого соединения не была проведена.
2.2.10.2. Селеноаминокислоты
Селен (Se) — это микроэлемент, необходимый в очень малых количествах; по мнению некоторых авторов, селен выполняет свою роль будучи включенным в аминокислоты, а не в неорга нической форме. Известно, что селен способен заменять серу в метионине и цистеине и что селенсодержащие аминокислоты могут функционировать в белках. Имеют ли селенсодержащие белки функции, которыми не обладают серусодержащие ана логи, остается неясным. Аминокислоты, содержащие селен, под вергались разделению с помощью газовой хроматографии в виде ТМС-производных, приготовленных реакцией с БСА [18], которые являются, по-вйдимому, неустойчивыми. Хорошо хрома тографируются И-ацетил-«-пропиловые эфиры Se-метионина и Se-карбоксиметилцистеина. Во всех случаях селеновый аналог имеет большее время удерживания. В стандартных условиях (рис. 5) производное метионина характеризуется временем удерживания 893с в отличие от 955с для селенового аналога (для фенилаланина — 971с). Карбоксиметилцистеин и Se-кар- боксиметилцистеин имели времена удерживания 1201 и 1252с соответственно (неопубликованные данные авторов).
96 |
ГЛАВА 2 |
2.2.11.Разделение стереоизомеров*
Удельное вращение плоскости поляризации света энантиоме рами многих биологически активных молекул часто мало; поля риметрические методы не всегда достаточно чувствительны, чтобы обнаружить следы изомера, сопутствующего большому избытку антипода. Такой анализ может иметь важное значение по нескольким причинам. При получении биологически актив ных пептидов влияние изомерных примесей кумулятивно: при сутствие 1% D-аминокислоты в каждой из аминокислот, вошед шей в 10-членный пептид, приведет к неактивному на 10% сое динению. Другая область, представляющая значительный инте рес, относится к обнаружению внеземной жизни. Уникальной особенностью макромолекул биологического происхождения яв ляется их способность различать и избирательно включать опре деленные оптические изомеры. Обнаружение преобладания одного оптического изомера на отдаленной' планете может рас сматриваться как указание на существование жизни [59]. Неуди вительно, что, несмотря на трудность разделения оптических изомеров на обычных жидких фазах, ГХ уделялось значительное внимание как быстрому способу их разделения и идентифика ции. Особенно успешными оказались два следующих подхода: (а) применение оптически активных жидких фаз и (б) введение в разделяемые соединения второго асимметрического центра.
2.2.11.1.Применение оптически активных жидких фаз
Первоначально этот метод был безуспешно применен к не скольким рацемическим смесям, не являющимися смесями ами нокислот [51, 73, 74], хотя в некоторых случаях достигалось очень слабое разрешение. На капиллярных колонках с лауриловым эфиром N-ТФА-изолейцина в качестве жидкой фазы [48] иссле дованы и частично разделены производные N-ТФА-аланина, этерифицированные четырьмя спиртами. Авторы этой работы опи сали почти полное разделение грег-бутилового эфира ТФА-ала- нина с циклогексиловым эфиром Ы-ТФА-ь-валил-ь-валина в качестве жидкой фазы на набивной колонке длиной, всего 2 м' [46]. Авторы полагают, что N-ТФА-грег-бутиловые эфиры других аминокислот должны разделяться на той же колонке. На капил лярных колонках с использованием лаурилового эфира N-ТФА-
изолейцина и циклогексилового эфира |
Ы-ТФА-ь-фенилаланина |
в качестве жидких фаз разделены 18 |
энантиомерных пар [48]. |
В условиях хроматографирования не происходит рацемизации эфиров N-ТФА-аминокислот [101], поэтому указанным методом можно точно определить долю каждого изомера в смеси. Воз-
* См . т а к ж е р а зд . 3 .6 этой книги.
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ АМИНОКИСЛОТ |
97 |
можные механизмы разделения рассматриваются в работах [37, 48, 120 и 135], при этом с разделением стереоизомеров связаны главным образом две последние статьи. Между разделяемыми изомерами и жидкой фазой, как полагают, существуют водород ные связи и, вероятно, электронные взаимодействия. В присут ствии оптически активной жидкой фазы из одного энантиомера непрочные диастереомеры будут образовываться несколько легче, чем из другого, и, следовательно, они будут удерживаться на колонке несколько дольше. Применение лаурилового эфира ь-изолейцина в качестве жидкой фазы показало, что изопропи ловые эфиры N-ТФА-ь-аминокислот удерживаются дольше со ответствующих D-эфиров, тогда как с лауриловым эфиром D-изолейцина наблюдается обратный порядок элюирования [48]. Функциональные группы, находящиеся в непосредственной бли зости от асимметрического центра, придают большие различия во временах удерживания, чем удаленные группы. Оптическую чистоту определяли также методом ЯМР в оптически активных растворителях [17, 95]. Метод ЯМР, а также метод ГХ на опти чески активных неподвижных фазах обладают тем преимуще ством, что позволяют точно определять концентрацию энантио меров в рацемической смеси. В любом из методов присутствие в оптически активном растворителе другого энантиомера отра зится на разделении, но не на определении абсолютных коли честв в рацемических смесях.
Если для гомологического ряда нанести логарифмы удержи ваемых объемов в зависимости от числа углеродных атомов, то для каждой конфигурации получится своя прямая линия [19, 37, 45, 49]. ГХ может найти применение как способ быстрого уста новления абсолютной конфигурации неизвестного соединения.
2.2.11.2.Диастереомеры
Более детально разработан метод введения второго асиммет рического центра в соединения рацемических смесей. В ряде систем наблюдалось, что при разделении l l , l d , d l и d d диастереомеров на оптически неактивных неподвижных фазах l l - и d d - соединения элюируются вместе перед l d - и DL-изомерами, кото рые также выходят вместе [45, 100, 127]. Это означает, что для
однозначного разделения рацемической смеси при введении вто рого асимметрического центра следует применять чистые энан тиомеры. В связи с разделением диастереомерных дипептидов на сефадексе [146] было высказано предположение о том, что в d l
соединениях предпочтительно образование циклических струк тур, тогда как в l l - и DD-формах существует тенденция к сохра
нению вытянутых цепей. Диастереомеры использовались для разделения оптических изомеров путем кристаллизации еще со
4 Зак , 26
98 ГЛАВА 2
времен Пастера. С помощью этого метода недавно были полу чены оптически чистые спирты для этерификации аминокислот [62]. Близость двух асимметрических центров и функциональных групп способствует разделению ГХ, и вполне вероятно, что, как и для упоминавшихся выше оптически активных фаз, разделе ние определяется электронными эффектами и водородным свя зыванием между диастереомером и неактивной жидкой фазой [120, 135]. На таких полярных фазах, как карбовакс, достигается лучшее разделение, чем на неполярных [101, 135].
Ы-ТФА-о-2-бутнловые эфиры разделяли на капиллярной ко лонке с карбоваксом 1540 или юконом LB 550 [100]. DD-эфиры элюировались раньше LD-соединений, и этим тестом определяли рацемизацию 11 аминокислот в ходе кислотного гидролиза бычьего сывороточного альбумина. Использовавшийся для по лучения эфиров бутаиол-2 содержал, к сожалению, только 90% D-изомера, тем не менее эта работа намечает путь развития точ ного анализа рацемических смесей. Для исследования рацеми зации, протекающей в ходе различных методов пептидного син теза, применяли также метиловые эфиры N-ТФА-валилвалина [143]. Эфиры N-ТФА-аминокислот со вторичными спиртами ис пользовали в исследовании ряда стереоизомеров: валин и ала нин [19], конфигурация аминокислот в антибиотике дорицин [20]; аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, глутаминовая кислота [44]; треонин, серин, оксипролин, цистеин, аспарагиновая кислота, тирозин и триптофан (О-ацетил, где это необходимо) [99]; аланин, валин, лейцин, изолейцин, алло- изолейцин (в этой работе для метионина, оксипролина, лизина, аспарагиновой и глутаминовой кислот — соединений с дополни тельными функциональными центрами — были получены плохо воспроизводимые результаты) [45]; и для исследования рацеми зации на колонках [101]. В нескольких работах второй асиммет рический центр вводили с помощью дипептидов: метиловый эфир L-сс-хлоризовалериламинокислоты [58]; метиловый эфир N-ТФА-ь-пролиламинокислоты [59, 60] (получение диастереомеров) [139]; N-ТФА-валилвалин (рацемизация в ходе пептидного синтеза) [143]; все комбинации аланина, глицина, валина, лей цина, изолейцина, метионина и фенилаланина в виде метило вых эфиров N-ТФА-дипептидов [141]; Ы-ТФА-S *-пролиламиды асимметрических аминов и эфиры аминокислот [135]. Исследо вались также ь-ментил-И-ТФА-аминокислоты [127].
Перевод в дипептиды для введения второго асимметриче ского центра приводит к потере летучести, поэтому маловеро ятно, чтобы таким образом. можно было анализировать мало
* Относится к S — /^-номенклатуре для обозначения оптически активных соединений.
ГАЗОВАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ АМИНОКИСЛОТ |
99 |
летучие аминокислоты. По этой причине, а также из-за того, что для точного определения состава рацемических смесей расщеп лением их на диастереомеры необходима оптическая чистота одного изомера, создается впечатление, что большее значение вскоре приобретет анализ рацемата непосредственно на оптиче ски активных неподвижных фазах.
2.2.12.Методы единичного, ограниченного или недавно предложенного применения
В этом разделе будут перечислены методы, не попавшие в другие разделы, потому что возможность их общего применения пока еще не доказана или не может быть доказана вообще.
Были приготовлены N-пентафторпропионил- и N-гептафтор- бутирилпроизводные для сравнения их с более привычными трифторацетильными производными. Эти производные для 14 аминокислот имели меньшие времена удерживания, чем со ответствующие ТФА-производные [98]. Автор рассматривает в качестве возможного преимущества для ГХ их большую лету честь и чувствительность к детектированию по электронному за хвату, хотя никаких количественных исследований он не про водил.
Для выяснения вопроса о присутствии цис-транс-З-окся-L- пролина в теломицине [68] М-карбобензокси-гранс-З-окси-оь- пролин был подвергнут хроматографическому анализу. Не сколько других изомерных производных пролина разделили в виде N-ацетил-н-бутиловых эфиров после удаления а-амино- групп остальных аминокислот в результате обработки азоти стой кислотой, оставляющей интактными иминогруппы изомеров пролина [92].
Реакция конденсации аминокислот с гександионом-2,5 [131] недавно предложена для использования в ГХ:
СН3
I
С
+ h 2n - r
Н2С \ с
I
СНз
Продукт конденсации этерифицируют затем раствором НС1 в метаноле. Эта реакция описана только для нескольких амино кислот, причем количественные данные не приводятся.
4 *
100 |
ГЛАВА 2 |
2.3.ТРИМЕТИЛСИЛИЛАМИНОКИСЛОТЫ
Замещение протона на триметилсилильную (ТМС)-группу (термин силилирование обычно используется именно в этом контексте) успешно применялось для приготовления летучих производных таких биологически важных соединений, как са хара [124], пуриновые и пиримидиновые основания,' нуклеозиды и нуклеотиды [42], стероиды [126], амины [63] и аминокислоты. В настоящее время имеется целый ряд реагентов и огромное число методов силилирования, причем выбор конкретных усло вий определяется исследуемым соединением и масштабами про водимой реакции. Соответствующие методы рассматриваются в появившемся недавно обзоре [94].
2.3.1.Силилирование с помощью ТМХС, ГМДС и ТМС — ДЭА *
Значительная часть работы была выполнена в основопола гающих исследованиях Рюльмана, изучавшего реакции транс- силилирования ТМС-аминокислот и аминов [104] и обнаружив шего неустойчивость ТМС-производных в водных, спиртовых и эфирных растворах. Отдельные силилированные группы в пол ностью силилированной аминокислоте значительно различаются по лабильности. На аминокислотах и модельных соединениях — гексановая кислота (СООН), октанол-1 (ОН) и н-октиламин (NH2) — было показано, что Si—N-связь более лабильна, чем Si—О-связь гидроксильной группы, которая, в свою очередь, ла бильнее связи Si—О карбоксильной группы [87]. Эти группы располагаются в обратном порядке по легкости введения ТМСгруппировок: карбоксильная группа легче всех силилируется и соответствующее производное наиболее устойчиво. При действии N-TMC-имидазола будет протекать силилирование ОН-групп, но не основных ЫНг-групп [63]. В какой степени возможно силили рование гуанидина, остается неизвестным, но можно думать, что эта группировка с наибольшей трудностью будет подвергаться превращению и окажется наиболее лабильной.
Можно полагать, что силилирование аминокислоты протекает в две стадии:
|
ТМС- |
тмс- |
RCHCOOH -----►RCHCOOSi(CH3)3 -----►RCHCOOSi(CH3)3 |
||
NH2 |
NH2 |
NHSi(CH3)3 |
Этерификация карбоксильной группы происходит легче и мо жет осуществляться в мягких условиях с применением ГМДС
* С м . сок р ащ ен и я в р а зд . 2.6.