Файл: Шахнович, А. Р. Математические методы в исследовании биологических систем регулирования.pdf
ВУЗ: Не указан
Категория: Не указан
Дисциплина: Не указана
Добавлен: 19.10.2024
Просмотров: 105
Скачиваний: 0
Сложность математической модели определяется той точностью, которая требуется в конкретном исследовании и зависит от коли чества камер, взаимосвязи между которыми учитываются. Наи более грубый подход состоит в рассмотрении органа как отдельной камеры.
Более тонкий подход предлагает исследование взаимосвязи внутриклеточной жидкости и клетки организма как двух разных камер.
Рис. 34. Схема управления метабо
лическими |
циклами (Jacob, Monod, |
|||||
1961) |
|
|
|
|
|
|
S i , S 2 |
— и с х о д н ы е с у б с т р а т ы ф е р м е н т о в ; |
|||||
Е і . Е., Р , , Рг |
— к о н е ч н ы е п р о д у к т ы с о о т |
|||||
в е т с т в у ю щ и х |
м е т а б о л и ч е с к и х |
ц и к л о в ; |
||||
Оі |
— |
Ь2 — р е п р е с с и я |
р е а к ц и и |
S , - » |
Р*; |
|
яа |
|
Î), — р е п р е с с и я |
р е а к ц и и |
S i ' - * |
Pu |
|
Oi |
— |
и н д у к ц и я фермента JE,; О, |
— и н д у к |
ц и я ф е р м е н т а Е а . П р и н а л и ч и и р а в н ы х и с х о д н ы х с у б с т р а т о в д л я с и н т е з а ф е р м е н
тов ( S i , S j ) |
м е т а б о л и ч е с к и е п р о ц е с с ы б у |
д у т в н а ч а л е |
ИДТИ С о д и н а к о в ы м и к о н е ч н ы |
м и р е з у л ь т а т а м и ( Р і , Рг). О д н а к о п о д в л и |
я н и е м д а ж е с л а б о г о в о з д е й с т в и я в с и с т е м е в о з н и к а е т а с и м м е т р и я , к о т о р а я н е и з б е ж н о
у г л у б л я е т с я и п р и в о д и т к т о м у , что и з |
д в у х |
в о з м о ж н ы х к о н е ч н ы х п р о д у к т о в |
б у д е т |
в ы р а б а т ы в а т ь с я о д и н |
|
Наиболее тонкий подход приводит к учету клеток различных типов. Тогда рассматривается n -f- 1-камерная система (п — кле
ток |
и |
жидкость). |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Линейная модель динамики метаболизма может быть получена |
||||||||||||
следующим образом (Рашевски, 1966). |
|
|
|
|
|
|
||||||
Рассмотрим систему, |
состоящую из п камер. |
В |
процессе |
об |
||||||||
мена участвует к метаболитов (к = |
\...т), |
которые продуцируются |
||||||||||
или потребляются в некоторых из п камер. |
|
|
|
|
|
|||||||
Процесс обмена осуществляется с помощью диффузии из і-й |
||||||||||||
камеры в Z-ro смежную |
камеру. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
Пусть ѴІ — объем |
і-ж камеры; |
сік |
— концентрация |
к-ѵо мета |
||||||||
болита в і-й камере. Если считать, что объем' і-й камеры VT |
= |
|||||||||||
=const, то изменение концентраций /с-го |
метаболита |
в |
і-й |
камере |
||||||||
может быть представлено в виде |
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
~ОГ |
= |
2l ß'-i. I (Clr |
— |
Cir) |
+ Яіг, |
|
|
|
|
|
где qik. |
— удельная скорость образования метаболита. 6г,-,г = |
a |
|
|||||||||
-irтг I |
|
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
' і |
|
удельный коэффициент проницаемости мембраны [между |
камерами |
|||||||||||
і и |
I. |
Полученное |
выражение представляет |
собой |
линейную |
154
модель динамики процесса метаболизма и может быть исполь зовано для определенных исследований. Однако при выводе этого выражения не учтены некоторые довольно существенные положе ния теории метаболизма. Так, при выводе первого члена правой части приток принят пропорциональным разности концентрации, что, вообще говоря, несправедливо для случая «активного тран спорта», метаболита и при учете конвекции, где зависимости имеют
нелинейный характер. Скорость образования метаболита qik |
в об |
|||||||||
щем |
виде |
также является |
нелинейной |
функцией |
концентра |
|||||
ции |
сІІ:. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
В общей форме нелинейная модель метаболизма может быть |
||||||||||
представлена (Дечев, Матвеев, 1969) |
как: |
|
|
|
|
|||||
|
|
-J7 = |
ЯІ. (^О) хп) — |
&іхи |
|
|
|
|||
|
|
-Jf |
— |
Kn-lxn-l |
<7n (a 'n)i |
|
|
|
||
где |
q (x0, |
x„) — скорость |
образования |
конечного |
продукта; |
|||||
q(xn) |
— скорость потребления конечного продукта; |
ха |
— концент |
|||||||
рация вначале; xt — концентрация в |
і-й |
момент |
времени; |
Kt — |
||||||
константы |
скорости, |
или |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
j t |
= / ( З і . |
. .Xn,Ux. |
. . |
и,), |
|
|
|
где ut — управление.
Однако нелинейное представление достаточно сложно для ана литического исследования. Поэтому при составлении математиче ской модели метаболического процесса представляется целесообраз ным использование метода квазилинеаризации (Buell, Kalaba, 1969) или более общего идентификационного подхода (Bellman, 1969).
Выше, в главе 1-1, была приведена идентификационная про цедура, основанная на квазилинеаризации. Эта процедура успеш но применяется для аналитического исследования метаболических процессов. Bellman, Jasques, Kalaba (1967) эту процедуру исполь зовали для определения в нелинейном дифференциальном урав нении кинетики химических процессов
^ = к{а-х){Ь-хУ — Кх* (ІИ-2-1)
скоростных констант к ж К при наличии экспериментальных дан ных.
При условии к — О, К = |
0 и известных значениях |
а и b миними |
зацией выражения |
|
|
<?= |
S ( * ( * i ) - W i ) 2 |
(ИІ-2-2) |
152
с помощью четырех итерации получено значение констант с ошиб кой 15%..
Выше приведена линейная модель нормального метаболического процесса без внешних возмущений. Значительный интерес для практики представляет исследование процесса метаболизма при наличии внешнего возмущения — введении препарата в орга* низм.
Пусть г; — скорость введения метаболита; х — общее коли чество препарата в крови; у — общее количество препарата в тка
ни; |
Ѵх |
— объем крови; Ѵ2 — объем ткани; S — площадь мембра |
|||
ны; |
h — проницаемость; % — коэффициент |
распределения. |
|||
Тогда |
концентрация препарата |
в крови сх |
= х/Ѵх, |
||
|
|
|
|
|
у |
|
|
концентрация препарата |
в ткани с2 = рг , |
||
|
|
, |
Sh |
л |
кѴх |
|
|
константы к = -—, |
К — —- , |
||
|
|
|
V |
|
К 2 |
кх — константа распада.
С учетом изложенного выше общая скорость изменения содержа ния препарата в крови складывается из скорости введения и ско рости исчезновения, т. е. дифференциальное уравнение имеет вид
d£-v-k{x-%y) |
— kx. |
(III-2-3) |
Здесь первый член правой части характеризует скорость введения, второй член — переход метаболита из крови в ткань, третий — исчезновение метаболита. Аналогично общая скорость изменения количества препарата в ткани описывается выражением
% = к{х-%у)-кц/ |
(ИІ-2-4) |
(где к2 — константа распада в ткани). Таким образом, в линейном представлении динамика описывается уравнениями (ПІ-2-3) и (ИІ-2-4).
Одну из моделей кинетики химических процессов рассмотрели Gonsalez-Fenandes,' Atta (1968). Модель описывается двумя зависи мыми переменными Q и £, удовлетворяющими уравнениям в част ных производных
где jDr , DZ— значения коэффициентов диффузии в направлениях г и z цилиндрических координат; ср (Q) — функция концентрации кислорода Q для времени і.
153
Для кинетики |
субстрата энзима |
|
|||
с начальными |
условиями |
|
|
||
^ |
= 0 |
для |
г = г,; |
0 < z < z c ; |
|
^ |
= |
0 |
для |
0 < r < r , ; |
z = 0; |
^ |
= |
0 |
для |
0 |
z = zc ; |
|
|
гс сЯ (І) Ç - гс с/ (І) -f rc vc | 5 - |
2Д . g |
= О |
|
|||
|
|
|
для r = rc; |
0 ^ z ^ |
zc |
|
|
|
и |
уравнению в частных |
производных |
|
|
|
|||
|
|
І = 4 ( Д Ш < 2 ( г с , * ) - / © ) , |
|
|
||||
г д е |
|
[ н ь Д ш к ц |
- Ф у н |
к Ц и я |
Фракции. |
|
|
|
|
|
|
с == [Hb] + [ Н Ь 0 2 ] , |
|
|
|||
|
|
|
д(і) = д;®(і-9, |
|
|
|||
|
|
|
/(I) |
=5C (Ê)| |
|
|
|
|
и |
граничным условием £ (0) = |
| А , где | А — артериальное |
значе |
|||||
ние. На основании данного математического представления |
полу |
|||||||
чены |
результаты с помощью итеративной |
процедуры. |
|
|||||
|
Выше были приведены некоторые линейные и нелинейные мо |
|||||||
дели |
динамики метаболизма. |
|
|
|
|
|||
|
В математическом исследовании динамики метаболизма воз |
|||||||
можны следующие задачи |
(Шапиро, 1970). |
|
|
|||||
|
I . Исследование влияния параметров камер (площади, про |
|||||||
ницаемости и т. д.) на динамику |
процесса в линейной и нелиней |
|||||||
ной моделях. |
|
|
|
|
|
|
||
|
I I . |
Исследование |
динамики |
метаболизма |
при введении |
по |
стоянного возмущения ѵ, что сводится к решению дифференциаль ных уравнений.
I I I . Определение оптимального процесса метаболизма при вве дении возмущения с постоянной скоростью или скоростью, зави сящей от времени ѵ (t) для заранее сформулированного критерия качества процесса.
Требования к качеству при исследовании оптимальной дина мики метаболизма могут быть весьма разнообразными:
—оптимальное быстродействие (при исследовании перехода метаболита из одного состояния (количества) — в другое);
154
—оптимальное качество изменения концентрации метаболита;
—оптимальное приближение семейства случайных процессов динамики метаболизма к желаемому детерминированному процессу.
Во всех перечисленных случаях может быть записан функцио нал вида
т
J = ^ с(х, и, t) dt.
|
о |
I V . Исследование |
процесса метаболизма с учетом динамичес |
кого взаимодействия |
двух процессов с противоположными ин |
тересами (синтез и распад, образование и потребление продукта и т. д.), происходящее в сложных .условиях (по температуре, давлению pH и т. д.), при наличии побочных продуктов обмена (Болдуин, 1949).
Среди перечисленных выше задача I является обычной задачей анализа и имеет практическое значение. Для ее решения необхо димы конкретные исходные данные. Решение этой задачи (Рашевски, 1966) имеет вид: изменение количества препарата в крови описывается уравнением
а изменение количества препарата в ткани описывается уравне нием
Ѵ_Г_і_ ,л _ - K t \ _ 1 - e-( A '-+ g '> ' I
Эти уравнения имеют широкое применение при исследовании ме таболических процессов.
При решении задач класса I I I представляется целесообразным использование принципа максимума Л. С. Понтрягина (см. главу 1-2), так как здесь имеют место математическая модель, критерий качества, граничные условия. Оптимальная задача, как известно, формулируется следующим образом: определить управление, принадлежащее к классу допустимых, переводящее точку в фазо вом пространстве состояний, динамика которой описывается
уравнением |
|
^ = Ах + Bu, |
I и I L |
так, чтобы критерий качества достигал экстремального значения. Рассмотрим линейную модель, которая характеризует введе
ние, накопление и удаление лекарственных веществ.
Пусть |
р — количество лекарственных веществ, которые могут |
|
быть введены в организм; |
|
то — количество лекарственного вещества р на времени |
|
£, введенного в организм; |
155